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Single Round (single + round)
Selected AbstractsA combination of baiting and PCR techniques for the detection of Phytophthora quercina and P. citricola in soil samples from oak standsFOREST PATHOLOGY, Issue 2 2001Nechwatal A description is given of the use of a combination of polymerase chain reaction (PCR) and baiting techniques for the specific detection of Phytophthora quercina and Phytophthora citricola from soil around declining oak trees. The soil was flooded with water and subjected to a specific baiting procedure using Quercus robur leaflets as baits. Single round or nested PCR, respectively, with species-specific primers allowed the detection of P. quercina and P. citricola in infected oak leaflets used as baits and in the water from the same bait tests. PCR detection of both fungi was also possible after soil samples had been thoroughly mixed with water and the floating organic debris had been collected. Phytophthora quercina and P. citricola could be readily detected in almost every case in the water from these tests by PCR but less frequently in the organic debris. The identities of P. quercina and P. citricola were confirmed by restriction digests of the corresponding PCR amplicons. The presence of both fungi was also confirmed in parallel in soil samples tested by baiting with oak leaflets. Nested PCR with the primers used allowed the detection of as few as five zoospores of P. citricola and 300 zoospores of P. quercina in a volume of 100 ,l. The methods presented here allow detection and identification of species of Phytophthora in soil without the need for direct extraction of soil samples, and without specific knowledge of the morphological characteristics of the genus. Détection de Phytophthora quercina et de P. citricola dans le sol de chênaies par une méthode combinant le piégeage et la PCR L'article décrit la détection spécifique de Phytophthora quercina et de P. citricola dans le sol prélevé autour de chênes dépérissants, par une méthode combinant les techniques de piégeage et de PCR. Le sol a été immergé dans l'eau et soumis à la procédure du piégeage avec de très jeunes feuilles de Quercus robur. Une amplification par PCR simple ou par PCR gigogne, respectivement, avec des amorces spécifiques des espèces ont permis de détecter P. quercina et P. citricola dans les feuilles-piège infectées, et dans l'eau de piégeage. La détection des deux champignons par PCR a aussi été possible après que les échantillons de sol aient été soigneusement mélangés à de l'eau et que les débris organiques aient été collectés. Phytophthora quercina et P. citricola ont pu être facilement détectés par PCR dans presque tous les cas dans l'eau de piégeage, mais moins fréquemment dans les débris organiques. L'identité de P. quercina et de P. citricola a été confirmée par les profils de restriction des amplifiats obtenus. La présence des deux champignons a aussi été confirmée en parallèle dans des échantillons de sol par piégeage. L'amplification par PCR gigogne avec les amorces utilisées a permis la détection de seulement 5 zoospores de P. citricola et 300 zoospores de P. quercina, dans un volume de 100 ,l. Les méthodes présentées ici permettent la détection et l'identification des espèces de Phytophthora dans le sol en évitant l'extraction directe d'ADN du sol, et sans connaissances spécifiques sur les caractéristiques morphologiques du genre. Eine Kombination von Köder- und PCR-Techniken zum Nachweis von Phytophthora quercina und P. citricola in Bodenproben von Eichenstandorten Es wird der spezifische Nachweis von Phytophthora quercina und P. citricola in Bodenproben von absterbenden Eichen mit Hilfe einer Kombination von PCR- und Baiting-Methoden beschrieben. Die Bodenproben wurden mit Wasser geflutet und Baiting-Tests unterzogen, bei denen junge Blättchen von Quercus robur als Köder zum Einsatz kamen. Einfache oder nested PCR-Reaktionen mit artspezifischen Primern erlaubten den Nachweis von P. quercina und P. citricola in den infizierten Eichenblättchen aus diesen Tests und im jeweiligen ,Baiting-Wasser'. Der PCR-Nachweis beider Erreger war auch möglich, wenn Bodenproben gründlich mit Wasser gemischt wurden, das aufgeschwemmte organische Material abgesammelt und das Wasser abgenommen wurde. P. quercina und P. citricola wurden dabei in nahezu allen Fällen im Wasser, jedoch weniger regelmäßig im organischen Material nachgewiesen. Die Identität der betreffenden Arten wurde zusätzlich durch Restriktions-Analysen der entsprechenden Amplicons bestätigt. Außerdem wurde die Anwesenheit beider Arten in den untersuchten Bodenproben durch klassische Baiting-Methoden nachgewiesen. Nested PCR mit den verwendeten Primerpaaren erlaubte den Nachweis von nur 5 Zoosporen von P. citricola und 300 Zoosporen von P. quercina in einem Gesamt-Volumen von 100 ,l. Die beschriebenen Methoden ermöglichen Nachweis und Identifizierung von Phytophthora-Arten in Bodenproben, ohne die Notwendigkeit einer direkten Extraktion des Bodens und ohne weitreichende Kenntnis der morphologischen Merkmale der Arten dieser Gattung. [source] Polar body biopsy and aneuploidy testing by simultaneous detection of six chromosomesPRENATAL DIAGNOSIS, Issue 10 2005Markus Montag Abstract Objectives To simultaneously detect six chromosomes in a single round of fluorescence in situ hybridization (FISH) during polar body diagnosis and aneuploidy testing in human in vitro fertilization (IVF) treatment. Methods A commercially available five-color FISH probe was modified by an additional chromosome probe. This kit was first tested on lymphocyte spreads and then used for polar body diagnosis (PBD) in patients with advanced maternal age and repeated implantation failure. The outcome of IVF treatment was compared with a control group. Results All six chromosomes could be simultaneously detected and easily distinguished by FISH analysis. PBD and aneuploidy testing were performed in 75 treatment cycles and compared with 126 controls. The biochemical pregnancy rate was significantly higher in the PBD group (37.1% vs 22.9%, p < 0.05) and a trend was observed for higher clinical pregnancy and implantation rates (24.22% and 14.4% vs 18.62% and 10.8%, respectively) and lower abortion rates (20% vs 31.8%) following PBD. Conclusions The simultaneous detection of six chromosomes in a single FISH round is possible and can be applied to PBD. This approach may present another step towards increasing the number of chromosomes for aneuploidy testing. Copyright © 2005 John Wiley & Sons, Ltd. [source] The Effect of Refinancing Costs and Market Imperfections on the Optimal Call Strategy and the Pricing of Debt ContractsREAL ESTATE ECONOMICS, Issue 4 2005Kenneth B. Dunn This article, which was originally written in 1986, develops a methodology for valuing mortgage-backed securities with refinancing costs. We solve simultaneously for the valuation of the mortgage-backed security (loan) and the borrower's refinancing strategy, pricing all coupon levels simultaneously. Because the borrower may refinance his or her loan and incur costs at many times in the future, the optimal refinancing decisions arise from an optimal dynamic strategy that reflects the costs of all potential future refinancings. Though the borrower faces multiple rounds of refinancing costs, the market value of the loan cannot exceed the call price plus a single round of refinancing costs. [source] Testing and Implementing the Use of Multiple Bidding Rounds in Conservation Auctions: A Case Study ApplicationCANADIAN JOURNAL OF AGRICULTURAL ECONOMICS, Issue 3 2009John Rolfe Conservation auctions are typically framed as closed, discriminatory, single round, first-price auctions, and are based on the assumption that landholders will offer bids determined by their "independent private values." Where landholders are unfamiliar with conservation tender processes and the supply of environmental services, they may find it very difficult to construct bids in this way. Bid values may be influenced by other factors, such as concerns about "winner's curse," a desire to capture economic rent, and premiums for risk and uncertainty factors. Sealed, single round auctions may exacerbate information gaps and uncertainty factors because of the limited information flows compared to traditional market exchanges and open, ascending auctions. In this paper, the cost efficiencies of a multiple bidding round auction for landholder management actions are explored with the use of field experiments and a conservation auction. The case study application is improved grazing management in a rangeland area of Australia, where landholders are unfamiliar with supplying environmental services or conservation auctions. Results suggest that multiple round auctions may be associated with efficiency gains, particularly in initial rounds. Les enchères pour la conservation sont généralement des enchères au premier prix, à un tour, discriminatoires et par offre écrite. Elles reposent sur l'hypothèque que les offres des propriétaires fonciers refléteront leur ,valeur privée,. Lorsque les propriétaires fonciers ne sont pas familiers avec les processus d'enchères pour la conservation et la prestation de services environnementaux, ils peuvent éprouver de la difficultéà attribuer une valeur à leur offre. Cette valeur peut-être influencée par d'autres facteurs, tels que la crainte de la ,malédiction du vainqueur ,, le désir de réaliser une rente économique, les primes de risque et les facteurs d'incertitude. Les enchères scellées à un tour peuvent aggraver le manque d'information et les facteurs d'incertitude étant donné que les enchérisseurs disposent de peu d'information comparativement aux enchères ascendantes ouvertes traditionnelles. Dans le présent article, nous avons examiné, à l'aide d'expériences sur le terrain et d'enchères pour la conservation, l'efficacité-coût d'une enchère à tours multiples pour des mesures de gestion de la part de propriétaires fonciers. L'exercice visait à améliorer la gestion des pâturages d'un parcours naturel en Australie, où les propriétaires fonciers ne sont pas familiers avec la prestation de services environnementaux ni avec les enchères pour la conservation. Les résultats autorisent à penser que les enchères à tours multiples pourraient offrir des gains d'efficience, particulièrement durant les premiers tours. [source] | |||||||||||||