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    Selected Abstracts

    Some new taxa of Astragalus L. (Leguminosae) from China and Nepal

    FEDDES REPERTORIUM, Issue 3-4 2006
    L. R. Xu Prof. Dr.
    During the work on the genus Astragalus for the Flora of China, some more new species could be found among the unnamed material from the herbaria of Beijing and Kunming. Furthermore a new section had to be described. They are described here: Sect. Poliothrix:A. blandulus, A. hysophilus, A. jumlaensis, A. montivagus, A. oreocharis, A. praeteritus, A. yutaniensis; Sect. Pseudosesbanella sect. nova: A. notabilis. (© 2006 WILEY-VCH Verlag GmbH & Co. KGaA, Weinheim) Einige neue Taxa von Astragalus L. (Leguminosae) aus China und Nepal Im Verlauf der Bearbeitung der Gattung Astragalus für die englische Version der "Flora of China" wurden einige weitere neue Arten in dem unbestimmten Material der Herbarien von Peking und Kunming entdeckt. Auch eine neue Section der Gattung wurde gefunden. Sie werden hier beschrieben: Sect. Poliothrix : A. blandulus, A. hysophilus, A. jumlaensis, A. montivagus, A. oreocharis, A. praeteritus, A. yutaniensis; Sect. Pseudosesbanella sect. nova: A. notabilis. [source]

    Delimiting morphologically identical varieties of soybean [Glycine max (L.) Merr.] using lipoxygenase activitity level

    FEDDES REPERTORIUM, Issue 3-4 2005
    M. S. Ayodele
    The occurrence of beany flavour resulting from lipoxygenase activity in soybeans was sufficiently manifested in all the 22 varieties of soybean investigated. There were significant differences in the level of lipoxygenase activity among varieties. A positive correlation was observed between lipoxygenase activity and beany flavour. Lipoxygenase activity level was found reliable in delimiting the varieties. A considerable degree of overlaps and associations were observed among the varietal grouping based on lip- oxygenase activity values. Such overlaps corroborate the reported closeness of plant morphological attributes of the varieties. Lipoxygenase activity was therefore, considered a reliable chemotaxonomic tool that could be useful for taxa delimitation, where there are very similar morphological attributes that may hinder easy delimitation. (© 2005 WILEY-VCH Verlag GmbH & Co. KGaA, Weinheim) Abgrenzung von morphologisch identischen Varietäten der Soyabohne [Glycine max (L.) Merr.] mittels aktiver Lipoxygenase Das Auftreten eines bohnenähnlichen Geruchs (soybean flavour) als Ergebnis der Lipoxygenase-Aktivität wurde in allen untersuchten 22 Sojabohnen-Sorten eindeutig nachgewiesen. Im Niveau der Lipoxygenase-Aktivität treten zwischen den einzelnen Sorten manifeste Unterschiede auf. Zwischen der Lipoxygenase-Aktivität und dem bohnenartigen Geruch wurde eine positive Korrelation beobachtet. Die Höhe der Lipoxygenase-Aktivität trennt die Sorten zuverlässig. Ein beträchtlicher Grad an Überschneidungen und von Gemeinsamkeiten wurde zwischen den auf Grund der Lipoxygenase-Aktivitätswerte gebildeten Sortengruppen gefunden. Die Überschneidungen bestätigen die Nähe der morphologischen Merkmale der Sorten. Die Lipoxygenase-Aktivität wird daher als eine verlässliche taxonomische Hilfe für die Trennung der Sippen angesehen, deren große morphologische Nähe eine leichte Trennung erschwert. [source]

    Vier neue Arten aus den Gattungen Leucoagaricus und Leucocoprinus mit bräunlichen bis rußfarbigen Tönungen in den Hutfarben,

    FEDDES REPERTORIUM, Issue 1-2 2004
    P. Mohr
    Vier neue Arten aus den Gattungen Leucoagaricus und Leucocoprinus werden beschrieben und gegen bekannte ähnliche Arten abgegrenzt. Leucoagaricus fuligineodiscusP.Mohr & E.Ludwig sp. nova stammt aus Brandenburg im östlichen Teil Deutschlands. Die anderen drei Arten, Leucoagaricus atroalbusP.Mohr & R.M.Dähncke sp. nova, L. brunneosquamulosusP.Mohr & R.M.Dähncke sp. nova und Leucocoprinus canariensisP.Mohr & R.M.Dähncke sp. nova, wurden auf La Palma, Kanarische Inseln (Spanien) gefunden. Leucocoprinus mauritianus(Henn.) P.Mohr wird neu kombiniert, Leucocoprinus heinemanniiMigliozzi var. melanotrichoides P.Mohr neu aufgestellt. (© 2004 WILEY-VCH Verlag GmbH & Co. KGaA, Weinheim) Four new species of Leucoagaricus and Leucocoprinus with brownish to fuliginous hues of the pileus Four new species of Leucoagaricus and Leucocoprinus are described and delineated against other similar species. Leucoagaricus fuligineodiscusP.Mohr & E.Ludwig sp. nova was found in Brandenburg in East Germany. The other three species Leucoagaricus atroalbusP.Mohr & R.M.Dähncke sp. nova, L. brunneosquamulosusP.Mohr & R.M.Dähncke sp. nova and Leucocoprinus canariensisP.Mohr & R.M.Dähncke sp. nova were collected in La Palma, Canary Islands (Spain). Leucocoprinus mauritianus(Henn.) P.Mohr is newly combined, Leucocoprinus heinemanniiMigliozzi var. melanotrichoidesP.Mohr is a new variety. [source]

    Gremmeniella abietina types cannot be distinguished using ascospore morphology

    FOREST PATHOLOGY, Issue 6 2006
    A. Uotila
    Summary Twenty-one Gremmeniella abietina var. abietina type A and 12 type B samples with ripened apothecia were collected in Sweden and Finland. Morphological dimensions of the ascospores were determined with an image analyser (Leica Qwin). Measured variables included length, width, perimeter and roundness of ascospores. Variations in these variables overlapped between the two types. Type A ascospores were significantly shorter (mean length 15.8 ,m) than the type B ascospores (mean length 17.1 ,m). Type A ascospores were also significantly rounder than type B ascospores. Differences between these morphological characters were, however, too small to distinguish the types as separate taxonomical species. Round-pointed and acute ascospores were found in the same apothecium but in different asci. According to the hypervariable marker GAAA1000, both round-pointed and acute ascospores originated from the same two parents in normal segregation. Résumé Vingt-et-un échantillons avec des apothécies matures du type A de Gremmeniella abietina var. abietina et 12 du type B ont été récoltés en Suède et Finlande. Les dimensions morphologiques des ascospores ont été déterminées avec un analyseur d'images (Leica Qwin). Les variables mesurées sont la longueur, la largeur, le périmètre et la rondeur des spores. Les gammes de variation de ces différentes variables se recouvrent entre les deux types. Les ascospores de type A sont significativement plus courtes (longueur moyenne de 15.8 ,m) que les ascospores de type B (longueur moyenne de 17.1 ,m). Les ascospores de type A sont aussi significativement plus rondes que celles de type B. Les différences pour ces caractères morphologiques sont toutefois trop faibles pour distinguer les types comme des espèces taxonomiques différentes. Des ascospores arrondies et pointues ont été trouvées dans la même apothécie mais dans des asques différents. En se basant sur le marqueur hypervariable GAAA1000, on peut établir que les ascospores arrondies et pointues proviennent des mêmes deux parents en ségrégation normale. Zusammenfassung In Schweden und Finnland wurden 21 Gremmeniella abietina var. abietina Typ A- und 12 Typ B- Proben mit reifen Apothecien gesammelt. Folgende morphologische Messgrössen der Ascosporen wurden mit einem Image Analyser (Leica Quin) bestimmt: Länge, Breite, Umfang und Form. Die Variation der Variablen überlappte bei den beiden Typen. Die Typ A-Ascosporen waren signifikant kürzer (15,8 ,m mittlere Länge) als die Typ B-Ascosporen (17,1 ,m). Der Typ A hatte signifikant rundere Ascosporen als der Typ B. Die Unterschiede in den morphologischen Merkmalen waren jedoch zu gering, um zwei taxonomische Arten zu unterscheiden. Ascosporen mit runden und spitzen Enden wurden im gleichen Apothecium, jedoch in verschiedenen Asci gefunden. Mit dem hypervariablen Marker GAAA1000 erwiesen sich Ascosporen mit rundem und spitzem Ende als Nachkommen der gleichen Eltern mit normaler Segregation. [source]

    Survival and vitality of Gremmeniella abietina on Pinus sylvestris slash in northern Sweden

    FOREST PATHOLOGY, Issue 6 2006
    J. Witzell
    Summary Survival and vitality of Gremmeniella abietina on Pinus sylvestris slash was studied in northern Sweden during 2003 and 2004. Once a month between September 2003 and April 2004, two to three trees were cut down and debranched. Shoots with pycnidia were sampled at the felling date and then at every consecutive month. The percentage of germinated conidia from each shoot was calculated after 24, 48 and 72 h incubation. The vitality of G. abietina pycnidia in the slash remained high the whole period. Intact pycnidia were found on slash several months after the time of conidial sporulation, which indicates that new pycnidia may be produced on dead pine branches. Sampling of shoots from slash on 13- to 18-month-old clear-cuts showed conidial germination capacity as high as in pycnidia collected in fresh slash. Due to survival of G. abietina in slash it is recommended to postpone planting of P. sylvestris seedlings in northern boreal areas to the third vegetation period after sanitary clear-cuts. Résumé La survie et la vitalité de Gremmeniella abietina dans des rémanents de Pinus sylvestris ont étéétudiées dans le nord de la Suède pendant les années 2003 et 2004. Une fois par mois entre septembre 2003 et avril 2004, 2 ou 3 arbres ont été abattus et ébranchés. Des pousses avec pycnides ont étééchantillonnées à la date d'abattage et les mois suivants. Le pourcentage de conidies germées a été calculé pour chaque pousse après 24, 48 et 72 heures d'incubation. La vitalité des pycnides de G. abietina dans les rémanents est restée élevée tout au long de la période. Des pycnides intactes ont été trouvées dans les rémanents plusieurs mois après la période de sporulation conidienne, ce qui suggère que de nouvelles pycnides peuvent être produites sur des branches mortes de pin. Des échantillonnages de pousses dans des rémanents de coupes rases réalisées 13,18 mois plus tôt ont montré une capacité de germination des conidies aussi élevée que dans les pycnides collectées dans des rémanents fraîchement coupés. Du fait de la survie de G. abietina dans les rémanents, il est conseillé de reporter la plantation des semis de P. sylvestris dans les zones septentrionales boréales à la troisième saison de végétation après les coupes sanitaires. Zusammenfassung Das Überleben und die Vitalität von Gremmeniella abietina auf Schlagabraum von Pinus sylvestris wurde in den Jahren 2003 und 2004 untersucht. Zwischen September 2003 und April 2004 wurden in jedem Monat einmal 2,3 Bäume gefällt und entastet. Zum Zeitpunkt des Fällens und in jedem folgenden Monat wurden Triebe mit Pyknidien gesammelt. Von jedem Trieb wurde die Keimrate der Konidien nach 24, 48 und 72 Stunden Inkubation bestimmt. Während der gesamten Beobachtungsdauer blieb die Vitalität der Pyknidien im Schlagabraum hoch. Mehrere Monate nach der Sporulation wurden intakte Pyknidien gefunden, ein Hinweis darauf, dass möglicherweise neue Pyknidien auf den toten Kiefernzweigen gebildet wurden. Auf dem Schlagabraum von 13,18 Monate alten Kahlschlägen war die Keimfähigkeit der Konidien ähnlich hoch wie bei Pyknidien von frischem Schlagabraum. Aufgrund des langen Überlebens von G. abietina in Schlagabraum wird für die nördlichen borealen Gebiete empfohlen, nach phytosanitären Kahlschlägen P. sylvestris -Sämlinge erst in der dritten Vegetationsperiode zu pflanzen. [source]

    Records of Bursaphelenchus spp. intercepted in imported packaging wood at Ningbo, China

    FOREST PATHOLOGY, Issue 5 2006
    J. Gu
    Summary From January 2003 to June 2005, samples from 3416 batches of wooden packaging material were inspected for the presence of nematodes in the Ningbo Entry,Exit Inspection and Quarantine Bureau, China. Bursaphelenchus spp. were detected in 202 batches from 25 different countries. The following species were identified on the basis of their morphology and their intergenic transcribed spacer-restriction fragment length polymorphism (ITS-RFLP) patterns: B. xylophilus, B. fungivorus, B. rainulfi, B. hylobianum, B. thailandae, B. mucronatus, B. aberrans, B. lini, B. singaporensis, B. doui, B. conicaudatus, B. vallesianus, B. pinasteri, B. hofmanni and B. arthuri. The most frequently found species were B. mucronatus (57 batches), B. xylophilus (40 batches), B. fungivorus (21 batches), B. rainulfi (19 batches) and B. thailandae (nine batches). The pine wood nematode B. xylophilus was not only found in packaging wood imported from areas where it is known to occur (i.e. The United States of America, Japan, Korea, Hong Kong and Taiwan), but also from countries considered to be free of this dangerous pest (i.e. Brazil, Thailand, Belgium, The Netherlands, Italy and Spain). The occurrence of B. xylophilus in packaging wood from countries regarded as being free of the nematode can most likely be explained by the global circulation of wooden packaging material among infested and non-infested countries. Our findings emphasize the need to fully implement international standards on phytosanitary treatment of packaging wood, in order to prevent further spread of the pine wood nematode, and the need for careful re-examination of the current heat treatment measures. Résumé De Janvier 2003 à Juin 2005, des échantillons de 3416 lots de matériel d'emballage en bois ont été inspectés pour rechercher la présence de nématodes au bureau de quarantaine de Ningbo, en Chine. Des Bursaphelenchus spp. ont été détectés dans 202 lots en provenance de 25 pays différents. Les espèces suivantes ont été identifiées sur la base de leur morphologie et des profils de restriction de l'ITS: B. xylophilus, B. fungivorus, B. rainulfi, B. hylobianum, B. thailandae, B. mucronatus, B. aberrans, B. lini, B. singaporensis, B. doui, B. conicaudatus, B. vallesianus, B. pinasteri, B. hofmanni, et B. arthuri. Les espèces les plus fréquemment trouvées sont B. mucronatus (57 lots), B. xylophilus (40 lots), B. fungivorus (21 lots), B. rainulfi (19 lots) et B. thailandae (9 lots). Le nématode du pin, B. xylophilus, a été trouvé dans du bois d'emballage en provenance non seulement de zones où sa présence est connue (Etats-Unis, Japon, République de Corée, Hongkong et Taïwan) mais aussi de pays considérés comme indemnes de ce redoutable pathogène (Brésil, Thaïlande, Belgique, Pays-Bas, Italie et Espagne). La présence de B. xylophilus dans du bois d'emballage de pays considérés comme indemnes s'explique probablement par la circulation généralisée de matériel d'emballage en bois entre pays infestés ou non. Nos résultats soulignent la nécessité d'appliquer pleinement les normes de traitement phytosanitaire du bois d'emballage, afin d'éviter une plus grande dissémination du nématode du pin, et de réexaminer de façon approfondie les mesures actuelles de traitement thermique. Zusammenfassung Von Januar 2003 bis Juni 2005 wurde im Quarantäne-Inspektionsbüro in Ningbo, China, das Verpackungsholz von 3416 Sendungen nematologisch untersucht. Bursaphelenchus spp. wurden in 202 Sendungen aus 25 verschiedenen Ländern festgestellt. Folgende Arten wurden morphologisch und mit Hilfe der ITS-RFLP-Methode identifiziert: B. xylophilus, B. fungivorus, B. rainulfi, B. hylobianum, B. thailandae, B. mucronatus, B. aberrans, B. lini, B. singaporensis, B. doui, B. conicaudatus, B. vallesianus, B. pinasteri, B. hofmanni, und B. arthuri. Die am häufigsten gefundenen Arten waren B. mucronatus (57 mal), B. xylophilus (40), B. fungivorus (21), B. rainulfi (19) and B. thailandae (9). Der Quarantäneschädling B. xylophilus wurde nicht nur in Verpackungsholz aus Gebieten mit bekannter Verbreitung des Nematoden (USA, Japan, Republik Korea, Hongkong, Taiwan) gefunden, sondern auch aus Ländern, die als frei vom Kiefernholznematoden gelten (Brasilien, Belgien, Niederlande, Italien, Spanien). Die Feststellung von B. xylophilus in Verpackungsholz aus Nichtbefallsländern kann nur durch Zirkulation des Verpackungsholzes zwischen Befalls- und Nichtbefallsländern erklärt werden. Der mittlere prozentuale Anteil der jegliche Nematoden enthaltenden Packholzproben lag im Zeitraum von Januar 2000 bis August 2005 bei 21,3 %; eine klare Tendenz zur Zu- oder Abnahme war während dieser Jahre nicht erkennbar. Die Befunde unterstreichen die Notwendigkeit der strikten Anwendung international erarbeiteter Standards der phytosanitären Behandlung von Verpackungsholz zur Verhinderung der Verschleppung des Kiefernholznematoden und der Überprüfung der Wirksamkeit der zur Zeit angewandten Maßnahmen. [source]

    Associations between Tomicus destruens and Leptographium spp. in Pinus pinea and P. pinaster stands in Tuscany, central Italy

    FOREST PATHOLOGY, Issue 1 2006
    G. Sabbatini Peverieri
    Summary The association between Tomicus destruens and fungi of the genus Leptographium was studied in Pinus pinea and P. pinaster forests in Tuscany, central Italy. Fungi were isolated from adult beetles and from pine tissues from infested trees. On average, Leptographium spp. were associated with 18% of beetles in breeding galleries, 35% of emergent brood beetles and 18% of beetles undergoing maturation feeding in pine twigs. The fungal species most frequently identified were Leptographium wingfieldii and L. lundbergii while L. guttulatum and L. serpens were also found. Résumé L'association entre Tomicus destruens et des champignons du genre Leptographium a étéétudiée dans des forêts de Pinus pinea et P. pinaster de Toscane, en Italie centrale. Les champignons ont été isolés de scolytes adultes et de tissus de pins provenant d'arbres infestés. En moyenne, des Leptographium spp. sont associés à 18% des scolytes dans les galeries de reproduction, 35% des nouveaux scolytes adultes émergents et 18% des scolytes en repas de maturation sur les rameaux de pins. Les espèces fongiques les plus fréquemment identifiées sont Leptographium wingfieldii et L. lundbergii; L. guttulatum et L. serpens ont également été trouvés. Zusammenfassung Die Assoziation zwischen Tomicus destruens und Leptographium -Arten wurde in je einem Pinus pinea - und Pinus pinaster -Wald in der Toscana, Zentralitalien, untersucht. Die Pilze wurden aus adulten Käfern und aus dem Gewebe infizierter Bäume isoliert. Im Durchschnitt wurden bei 18% der Käfer in der Reproduktionsphase in Brutgängen, bei 35% der Käfer kurz vor dem Ausbohren und bei 18% der Käfer während des Reifungsfrasses an Kieferntrieben Leptographium spp. gefunden. Am häufigsten wurden L. wingfieldii und L. lundbergii nachgewiesen, daneben kamen auch L. guttulatum und L. serpens vor. [source]

    Rhizomorph production and stump colonization by co-occurring Armillaria cepistipes and Armillaria ostoyae: an experimental study

    FOREST PATHOLOGY, Issue 1 2006
    S. Prospero
    Summary In managed spruce forests, Armillaria cepistipes and A. ostoyae are efficient stump colonizers and may compete for these resources when they co-occur at the same site. The aim of this experiment was to quantify the mutual competitive ability of the two Armillaria species in producing rhizomorphs and in colonizing Norway spruce (Picea abies) stumps. Five isolates of A. cepistipes and two isolates of A. ostoyae were simultaneously inoculated pair-wise into pots containing a 4-year-old spruce seedling. For comparison, each isolate was also inoculated alone. One year after inoculation, stumps were created by cutting down the seedlings. Six months after creation of the stumps, rhizomorph production and stump colonization were assessed. Armillaria spp. were identified from 347 rhizomorphs and 48 colonized stumps. Armillaria cepistipes dominated both as rhizomorphs in the soil and on the stumps. Nevertheless, A. ostoyae was relatively more frequent on the stumps than in the soil and A. cepistipes was relatively more frequent in the soil than on the stumps. In both species, the ability to colonize the stumps in simultaneous inoculations was significantly reduced compared with single inoculations. In respect to rhizomorph production, simultaneous co-inoculations had a slightly stimulatory effect on A. cepistipes and no significant effect on A. ostoyae. Our study suggests a rather neutralistic co-existence of A. cepistipes and A. ostoyae as rhizomorphs in the soil. Concerning the ability to colonize stumps, the two species experience a mutual negative effect from the interaction, probably because of interspecific competition. Résumé Dans les forêts gérées d'épicéas, Armillaria cepistipes et Armillaria ostoyae sont de bons colonisateurs de souches et sont en compétition pour cette ressource quand ils sont présents ensemble dans le même site. L'objectif de l'expérimentation était de quantifier l'aptitude compétitive mutuelle des deux espèces d'Armillaria pour la production de rhizomorphes et la colonisation de souches d'épicéa commun (Picea abies). Cinq isolats de A. cepistipes et deux isolats de A. ostoyae ont été inoculés simultanément par paires dans des pots contenant chacun un semis d'épicéa de 4 ans. Chaque isolat a également été inoculé seul, à titre de comparaison. Un an après inoculation, les semis ont été coupés pour créer des souches. Six mois après la coupe, la production de rhizomorphes et la coloniasation des souches ont été estimées. Armillaria spp. a été identifiéà partir de 347 rhizomorphes et 48 souches colonisées. A. cepistipes domine à la fois sous forme de rhizomorphes dans le sol et dans les souches. Toutefois, A. ostoyae est relativement plus fréquent sur souches que dans le sol alors que l'inverse est observé pour A. cepistipes. Pour les deux espèces, l'aptitude à coloniser les souches a significativement été réduite dans le cas des inoculations simultanées par rapport aux inoculations simples. En ce qui concerne la production de rhizomorphes, les inoculations simultanées ont eu un léger effet stimulant sur A. cepistipes et pas d'effet significatif sur A. ostoyae. Nos résultats suggèrent une co-existence relativement neutre entre A. cepistipes et A. ostoyaeà l'état de rhizomorphes dans le sol. Concernant l,aptitude à coloniser les souches, les deux espèces subissent un effet négatif mutuel de l'interaction, provenant probablement de la compétition interspécifique. Zusammenfassung In bewirtschafteten Fichtenwäldern sind Armillaria cepistipes und Armillaria ostoyae effiziente Besiedler von Baumstümpfen und sie können um diese Ressource miteinander konkurrieren, da sie häufig gemeinsam vorkommen. Es wurde ein Experiment durchgeführt mit dem Ziel, die wechselseitige Konkurrenzfähigkeit dieser beiden Armillariaarten bezüglich ihrer Rhizomorphenproduktion und ihrer Fähigkeit zur Besiedlung von Fichtenstümpfen (Picea abies) zu quantifizieren. Fünf Isolate von A. cepistipes und zwei Isolate von A. ostoyae wurden gleichzeitig paarweise in Töpfe mit einem vierjährigen Fichtensämling inokuliert. Zum Vergleich wurde jedes Isolat auch alleine inokuliert. Ein Jahr nach der Inokulation wurden durch Abschneiden der Pflanzen Stümpfe erzeugt. Sechs Monate nach dem Schnitt wurde die Rhizomorphenproduktion und die Besiedelung der Stümpfe erfasst. Die beiden Arten wurden aus 347 Rhizomorphen und 48 besiedelten Stümpfen reisoliert. Armillaria cepistipes dominierte sowohl in Form von Rhizomorphen im Boden als auch in den Stümpfen. Armillaria ostoyae kam häufiger in den Stümpfen vor als im Boden und A. cepistipes wurde häufiger im Boden gefunden als in den Stümpfen. Bei beiden Arten war die Fähigkeit zur Stumpfbesiedelung bei gleichzeitiger Inokulation im Vergleich zur Einzelinokulation signifikant reduziert. Die gleichzeitige Inokulation mit beiden Arten stimulierte die Rhizomorphenproduktion bei A. cepistipes leicht, hatte aber keinen signifikanten Einfluss auf A. ostoyae. Diese Befunde deuten auf eine weitgehend neutrale Koexistenz der Rhizomorphen von A. cepistipes und A. ostoyae im Boden hin, bezüglich ihrer Fähigkeit zur Stumpfbesiedelung hemmen sich beide Arten aber gegenseitig. Dieser Effekt ist wahrscheinlich durch interspezifische Konkurrenz zu erklären. [source]

    Direct genotyping of the poplar leaf rust fungus, Melampsora medusae f. sp. deltoidae, using codominant PCR-SSCP markers

    FOREST PATHOLOGY, Issue 4 2005
    M. Bourassa
    Summary Two anonymous DNA markers that are revealed by single-strand conformational polymorphism (SSCP) analysis were developed for detection of polymorphisms in Melampsora medusae f. sp. deltoidae (Mmd). Mono-uredinial isolates of Mmd were first obtained, DNA was extracted from urediniospores and random amplified polymorphic DNA (RAPD) products of eight mono-uredinial isolates were separated on a SSCP gel to identify differences among them. Bands representing putative polymorphic loci among the eight isolates tested were excised from the SSCP gel and re-amplified by polymerase chain reaction (PCR), and then cloned and sequenced. A primer pair was designed to amplify a DNA fragment of a size suitable for SSCP analysis (<600 bp) for two out of three DNA fragments sequenced. Each set of primers amplified a PCR product for all eight isolates that were initially used to generate them and the resulting PCR products were analysed by SSCP. Polymorphisms among isolates were identified for both putative loci. The two primer pairs amplified a PCR product of the expected size on an additional 32 mono-uredinial isolates of Mmd tested. From the overall 40 mono-uredinial isolates tested, 5 and 11 alleles were detected, and 12 and 34 isolates showed to be heterozygous, as indicated by the presence of more than two bands on the SSCP gel, at loci A and B, respectively. The primer pairs were tested for specificity against 106 fungal isolates belonging to various taxa, including other rusts, and against DNA extracted from greenhouse-grown healthy poplar leaves. DNA amplification products of the expected size were obtained only when Mmd DNA was present. Optimization of PCR conditions with these two primer pairs allowed genotyping directly from single uredinia extracted from infected leaves, thus alleviating the need to culture the fungus to characterize individuals, hence making it possible to process large numbers of samples for population studies. Résumé Deux marqueurs génétiques anonymes, révélés par analyse SSCP (Single-Strand Conformational Polymorphism) ont été développés afin de détecter des polymorphismes génétiques chez le Melampsora medusae f. sp. deltoidae (Mmd). Dans un premier temps, des isolats mono-urédiniaux ont été obtenus, puis l'ADN a été extrait à partir des urédiniospores, les produits d'amplification RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA) ont été générés à partir de huit de ces isolats mono-urédiniaux et les résultats d'amplification ont par la suite été séparés sur gel SSCP afin d'identifier des polymorphismes entre les isolats. Les bandes sur gel SSCP représentant des loci polymorphiques putatifs entre les isolats ont été prélevées du gel, ré-amplifiées par la technique d'amplification PCR (Polymerase Chain Reaction), clonées, puis séquencées. Pour deux fragments d'ADN séquencés sur un total de trois, une paire d'amorces a été développée afin de permettre l'amplification d'un fragment de taille adéquate pour analyse SSCP (<600 pb). Chaque paire d'amorces a produit un signal d'amplification positif pour chacun des huit isolats à l'origine de ces nouvelles amorces; les produits PCR ont ensuite été analysés par la technique SSCP. Les deux loci putatifs ont révélé des polymorphismes génétiques entre les isolats. Les deux paires d'amorces ont produit un fragment d'amplification de la taille attendue pour chacun des 32 isolats mono-urédiniaux supplémentaires testés. Des 40 isolats testés, 5 et 11 allèles ont été détectés, alors que 12 et 34 isolats se sont révélés hétérozygotes (tel qu'indiqué par la présence de plus de deux bandes sur gel SSCP) pour les loci A et B, respectivement. La spécificité des deux paires d'amorces a été testée à partir de 106 isolats fongiques appartenant à différents groupes taxonomiques, incluant d'autres rouilles, de même qu'à partir de l'ADN extrait de feuilles de peupliers cultivés en serre. Un signal d'amplification positif n'a été obtenu qu'en présence d'ADN du Mmd. Les conditions d'amplification PCR ont été optimisées pour les deux paires d'amorces développées afin de permettre le génotypage directement à partir d'urédinies individuelles prélevées sur des feuilles de peuplier infectées. La possibilité de génotyper directement des urédinies individuelles permet d'éviter l'obligation de cultiver le champignon pour génotyper les individus, ce qui représente un avantage important des marqueurs génétiques développés ici, puisqu'il devient dès lors possible de traiter un grand nombre d'échantillons lors de la réalisation d'études de populations. Zusammenfassung Zum Nachweis von Polymorphismen bei Melampsora medusae f. sp. deltoidae wurden zwei anonyme DNA Marker aus einer SSCP-Analyse entwickelt. Zunächst wurden Isolate aus einzelnen Uredinien gewonnen, die DNA wurde aus den Uredosporen extrahiert und polymorphe RAPD, Amplifikationsprodukte von acht Mono-Uredinium-Isolaten wurden auf einem SSCP-Gel getrennt, um Unterschiede zwischen ihnen nachzuweisen. Banden, die bei den acht geprüften Isolaten mögliche polymorphe Loci darstellten, wurden aus dem SSCP-Gel ausgeschnitten und mit PCR reamplifiziert, dann geklont und sequenziert. Für zwei von insgesamt drei sequenzierten DNA-Fragmenten wurde ein Primerpaar entwickelt, um ein in der Grösse für die SSCP-Analyse (<600 bp) geeignetes DNA-Fragment zu amplifizieren. Jedes Primerpaar amplifizierte bei allen acht ursprünglich für ihre Entwicklung verwendeten Isolaten ein PCR-Produkt, und diese wurden anschliessend mit SSCP analysiert. Für beide putativen Loci wurden bei den Isolaten Polymorphismen festgestellt. Die beiden Primerpaare amplifizierten ein PCR-Produkt der erwarteten Grösse bei allen 32 zusätzlich geprüften Mono-Uredinium-Isolaten des Pilzes. Bei den insgesamt 40 geprüften Mono-Uredinium-Isolaten wurden für die Loci A und B 5 bzw. 11 Allele gefunden, und 12 bzw. 34 Isolate erwiesen sich als heterozygot, was durch mehr als zwei Banden auf den SSCP-Gelen angezeigt wurde. Die Spezifität der Primerpaare wurden mit 106 Pilzisolaten aus verschiedenen Taxa geprüft, darunter andere Roste sowie DNA aus gesunden Pappelblättern aus Gewächshauskulturen. DNA-Amplifikationsprodukte der erwarteten Grösse wurden nur erhalten, wenn DNA von Melampsora medusae f. sp. deltoidae präsent war. Die PCR-Amplifikations-Bedingungen mit diesen beiden Primerpaaren wurde so optimiert, dass ein Genotyping direkt bei einzelnen von infizierten Blättern entnommenen Uredinien erfolgen kann und somit eine Pilzkultur zur Charakterisierung von Individuen entfällt. Dies ermöglicht grosse Probenzahlen in Populationsstudien. [source]

    Interfertility between North American and European strains of Phlebiopsis gigantea

    FOREST PATHOLOGY, Issue 3 2005
    R. Grillo
    Summary Thirteen homokaryotic strains of Phlebiopsis gigantea from Canada, six strains from the US and 10 strains from Europe were paired in all possible combinations in order to determine the degree of interfertility between them. The diagnosis of interfertility was based on the production of heterokaryotic fruit bodies in the pairings. Among the resulting 406 pairings, 253 (62%) fruited. Within the strains originating from Canada, USA and Europe, 64, 80 and 64% of the pairings fruited, respectively. The fruiting frequency in pairings between the Canadian and US strains was 65%, between the Canadian and European strains 55%, and between the US and European strains 67%. True hybridization between the European and North American P. gigantea was shown by analysing the single-spore progeny using DNA fingerprinting. In spite of the relatively low interfertility in pairings within and between continents, no clear indication of the existence of intersterility groups was found. The low interfertility is probably due to the ageing of the pure cultures and to deficient fruiting ability of certain heterokaryons on agar medium. The results strongly suggest that although the North American and European strains of P. gigantea show some differentiation they can be regarded as belonging to the same biological species. Résumé Treize souches homocaryotiques de Phlebiopsis gigantea du Canada, 6 des Etats-Unis et 10 d'Europe ont été confrontées par paires selon toutes les combinaisons possibles pour déterminer leur degré d'interfertilité. Le diagnostic d'interfertilité est basé sur la production de fructifications hétérocaryotiques dans les confrontations. Parmi les 406 paires, 253 (62%) ont fructifié. Ce pourcentage est de 64, 80 et 64% respectivement pour les souches du Canada, des Etats-Unis ou d'Europe entre elles. La fréquence de fructification pour les confrontations entre souches du Canada et des Etats-Unis est de 65%, entre souches européennes et canadiennes de 55% et entre souches des USA et d'Europe de 67%. La réalité de l'hybridation entre souches européennes et nord américaines a été démontrée par analyse de la descendance de spores par empreinte génétique. Malgré la relativement faible interfertilité dans les confrontations intra ou inter continents, l'existence de groupes d'interstérilité n'a pu être montrée. La faible interfertilité est probablement due au vieillissement des cultures pures et à une faible capacitéà fructifier sur milieu gélosé de certains hétérocaryons. Les résultats suggèrent fortement que malgré une certaine différenciation entre souches nord américaines et européennes de P. gigantea, celles-ci peuvent être considérées comme appartenant à la même espèce. Zusammenfassung Zur Bestimmung der Interfertilität wurden 13 homokaryotische Isolate von Phlebiopsis gigantea aus Kanada, 6 aus den USA und 10 aus Europa in allen möglichen Kombinationen miteinander gekreuzt. Der Erfolg der Kreuzungen wurde anhand der Bildung von heterokaryotischen Fruchtkörpern beurteilt. Bei insgesamt 406 Kreuzungen wurden in 253 Fällen (62%) Fruchtkörper gebildet. Unter den Stämmen aus Kanada, den USA und Europa kam es in 64, 80 und 64% der Fälle zur Fruchtkörperbildung. Bei Paarungen zwischen Isolaten aus Kanada und den USA fruktifizierten 65%, bei Paarungen zwischen Isolaten aus Kanada und Europa waren dies 55%, Paarungen zwischen Isolaten aus den USA und Europa fruktifizierten zu 67%. Die echte Hybridisierung zwischen europäischen und nordamerikanischen Isolaten von P. gigantea wurde durch Analysen der Einzelsporisolate aus den Fruchtkörpern durch DNA-Fingerprinting nachgewiesen. Trotz der relativ geringen Interfertilität innerhalb und zwischen den Kontinenten wurden keine klaren Hinweise auf die Existenz von Intersterilitätsgruppen gefunden. Die geringe Interfertilität ist möglicherweise durch eine Degeneration der Kulturen in vitro und durch die fehlende Fähigkeit mancher Heterokaryen zur Fruchtkörperbildung auf Agarmedien erklärbar. Die Ergebnisse zeigen, dass Isolate von P. gigantea aus Nordamerika und Europa trotz einer gewissen geographischen Differenzierung zu einer einzigen biologischen Art gehören. [source]

    First records of soilborne Phytophthora species in Swedish oak forests

    FOREST PATHOLOGY, Issue 3 2003
    U. Jönsson
    Summary Thirty-two oak stands in southern Sweden, 27 with predominantly declining trees and five with a higher proportion of healthy trees were investigated regarding the presence of soilborne Phytophthora species. Phytophthora quercina, an oak-specific fine root pathogen, was isolated from rhizosphere soil samples in 10 of the 27 declining stands. Additionally, P. cactorum and P. cambivora were recovered from one stand each. No Phytophthora species were isolated from the healthy oak stands. The soil conditions at the sites from which Phytophthora spp. were recovered ranged from mesic sediments to moraines, with clayey to silty textures and with soil pH (BaCl2) between 3.5 and 5.0. The results show that P. quercina is geographically widespread in oak stands in southern Sweden and indicate that this pathogen may be one of the factors involved in oak decline in Northern Europe as has already been shown for western, Central and parts of southern Europe. Zusammenfassung In Südschweden wurden 27 erkrankte und 5 gesunde Eichenbestände auf das Vorkommen bodenbürtiger Phytophthora, Arten untersucht. Dabei wurde P. quercina, ein für Eichen spezifisches Feinwurzelpathogen, aus Rhizosphären , Proben von 10 der 27 erkrankten Bestände isoliert. Zusätzlich wurden P. cactorum und P. cambivora in jeweils einem erkrankten Bestand gefunden. Im Gegensatz dazu konnte in den gesunden Beständen keine Phytophthora, Art nachgewiesen werden. Die Bodenverhältnisse der Bestände, in denen Phytophthora spp. gefunden wurden, reichten von frischen bis feuchten Böden aus Sedimenten und Moränen mit schluffiger bis toniger Textur und pH , Werten (BaCl2) zwischen 3.5 und 5.0. Die weite Verbreitung von P. quercina in erkrankten Eichenbeständen in Südschweden spricht dafür, dass das Pathogen im Krankheitskomplex des Eichensterbens in Nordeuropa eine Rolle spielt, wie dies bereits für Mittel- und Westeuropa sowie Teile Südeuropas gezeigt worden ist. Résumé La présence d'espèces de Phytophthora telluriques a été recherchée dans trente-deux chênaies du sud de la Suède, 27 à dominance d'arbres dépérissants et 5 avec une plus forte proportion d'arbres sains. P. quercina, pathogène des racines fines et spécifique des chênes, a été isolé dans 10 des 27 échantillons de sol, prélevés dans la rhizosphère, des peuplements dépérissants. P. cactorum et P. cambivora ont également été isolés, chacun dans un de ces peuplements. Aucune espèce de Phytophthora n'a été isolée des peuplements sains. Les conditions édaphiques des sites d'où ont été isolés des Phytophthora spp. varient de sédiments mésiques à des moraines, avec des textures argileuses à limoneuses et un pH (BaCl2) compris entre 3.5 et 5.0. Ces résultats montrent que P. quercina présente une large répartition géographique dans les chênaies du sud de la Suède et indiquent que ce pathogène pourrait être l'un des facteurs impliqués dans les dépérissements de chênes du Nord de l'Europe, comme il a déjàété montré pour l'Europe Centrale, de l'Ouest et certaines zones de l'Europe du Sud. [source]

    Anisogramma virgultorum on saplings of Betula pendula and Betula pubescens in a district of northern Sweden

    FOREST PATHOLOGY, Issue 4-5 2002
    J. WITZELL
    Summary During the autumn of 1999, the occurrence of the ascomycete Anisogramma virgultorum on saplings of Betula pubescens and Betula pendula was studied in two stands of B. pubescens, two stands of B. pendula and two mixed (B. pubescens and Pinus sylvestris) stands (age approximately 10 years, mean height 2,4 m, d.b.h. 10,20 mm) in a district in the vicinity of Umeå, northern Sweden. Stem and branch cankers associated with A. virgultorum were found on 54.8% of the investigated saplings, without significant difference between B. pendula and B. pubescens. Cankers were observed on 16.0% of stems and on branches of 54.2% of the saplings. Stem cankers appeared on the current year's shoot, as well as at the base of the trees. The mean diameter of the damaged saplings was significantly greater than the mean diameter of undamaged saplings. All samples of cankers with stromata examined in the laboratory showed perithecia with asci. Résumé Anisogramma virgultorum sur jeunes plants de Betula pendula et Betula pubescens dans un district du nord de la Suède Pendant l'été 1999, le développement de l'ascomycète Anisogramma virgultorum a étéétudié sur de jeunes plants de Betula pendula et Betula pubescens dans deux peuplements de B. pubescens, deux peuplements de B. pendula et deux peuplements mélangés (B. pubescens et Pinus sylvestris) (âge: environ 10 ans, hauteur moyenne: 2 à 4 m, dbh: 10 à 20 mm), dans un district près d'Umeå au nord de la Suède. Des chancres de tige et de branches associés àA. virgultorum ont été trouvés sur 54,8% des plants, sans différences significative entre B. pendula et B. pubescens. Les chancres de tige étaient présents sur 16% des plants, et les chancres de branches sur 54,2%. Les chancres de tige étaient situés sur les pousses de l'année en cours aussi bien qu'à la base des arbres. La diamètre moyen des plants attaqués était significativement plus grand que celui des arbres sains. Tous les chancres avec stromas examinés au laboratoire présentaient des périthèces avec des asques. Zusammenfassung Anisogramma virgultorum an Sämlingen von Betula pendula und Betula pubescens in einem Distrikt in Nordschweden Im Herbst 1999 wurde das Vorkommen des Ascomyceten Anisogramma virgultorum an Betula pubescens und Betula pendula in jeweils zwei Reinbeständen dieser Baumarten sowie in zwei Mischbeständen (B. pubescens und Pinus sylvestris) in einem Distrikt in der Nähe von Umeå, Nordschweden, untersucht (Alter ca. 10 Jahre, mittlere Baumhöhe 2,4 m, DBH 10,20 mm). Bei 54,8 % der untersuchten Bäumchen wurden an Stamm und Zweigen Krebse gefunden, die für A.virgultorum typisch sind. Zwischen B. pendula und B. pubescens gab es keine signifikanten Unterschiede. Bei 16 % der Pflanzen wurden Krebse an den Stämmen, bei 54,2 % an den Zweigen beobachtet. Die Stammkrebse traten sowohl am diesjährigen Gipfeltrieb auf als auch an der Stammbasis. Der mittlere Durchmesser geschädigter Pflanzen war signifikant grösser als derjenige von ungeschädigten Pflanzen. Alle Proben von Krebsen mit Stromata, die im Labor untersucht wurden, enthielten Perithecien mit Asci. [source]

    Lebensspuren holzzerstörender Organismen an fossilen Hölzern aus dem Tertiär der Insel Lesbos, Griechenland

    FOSSIL RECORD-MITTEILUNGEN AUS DEM MUSEUM FUER NATURKUNDE, Issue 1 2001
    Herbert Süss
    Abstract Lebensspuren (Schadbilder) holzzerstörender Organismen an fossilen Holzresten aus dem Untermiozän von Lesbos (Griechenland) werden beschrieben. Von pflanzlichen Holzzerstörern konnten Bakterien, imperfekte Pilze, Weiß- und Braunfäulepilze und in das Holz eingewachsene Wurzeln nachgewiesen werden. Von tierischen Holzzerstörern wurden Termitenfraß, durch Pflanzensauger (Homopteren) verursachtes Wundgewebe, Larvenfraß der Kambium-Minierfliege Palaeophytobia (Agromyzidae, Diptera) und Fraßgänge mit Koprolithen verschiedener Käferarten (Anobiiden?) und Milben (Acari) gefunden. Außerdem werden durch Kristallisationsvorgänge im Holz verursachte kugelförmige Gebilde beschrieben. Traces of wood destroying organisms on fossil wood from the Lower Miocene of Lesbos (Greece) are described. Among nonanimal wood destroyers evidence is presented of bacteria, Fungi imperfecti, whiterot and brownrot fungus and penetrating roots. Animal wood destroyers include termite feeding traces, wound tissues produced by plant suckers (Homoptera), larval feeding traces of the cambium miner Palaeophytobia (Agromyzidae, Diptera) and feeding channels, with coprolites, of several beetle species (Anobiidae?) and Mites (Acari). In addition globe-like structures produced in the wood through crystallization processes are described. [source]

    Personalization versus Customization: The Importance of Agency, Privacy, and Power Usage

    HUMAN COMMUNICATION RESEARCH, Issue 3 2010
    S. Shyam Sundar
    What makes customization so appealing? Is it because the content is tailored or because the user feels greater agency? Study 1 tested these propositions with a news-aggregator Website that was either personalized (system-tailored), customized (user-tailored), or neither. Power users rated content quality higher when it had a customizable interface, whereas nonpower users preferred personalized content. In Study 2, half the participants were told that their browsing information may be used for providing requested services while the other half was told that it would not be used. The interaction found in Study 1 was observed only under conditions of low privacy, with the pattern being reversed under high privacy. Significant three-way interactions were found for sense of control and perceived convenience. Personalisierung vs. Kundenorientierung: Die Rolle von Agentschaft, Privatheit und Machtausübung Dieser Artikel dokumentiert zwei Studien. Studie 1 setzte Vielnutzer und Normalnutzer einer Nachrichtenaggregationswebseite aus, welche entweder personalisiert (system-zugeschnitten), kundenorientiert (nutzerzugeschnitten) oder keines von beiden war. Die Ergebnisse zeigen eine Kreuzinteraktion dahingehend, dass Vielnutzer die Qualität des Inhalts höher einstuften, wenn sie die kundenorientierte Oberfläche nutzten, während Normalnutzer den personalisierten Inhalt bevorzugten. In Studie 2 wurde der Hälfte der Teilnehmer erzählt, dass ihre Surfinformationen möglicherweise genutzt werden, um die abgefragten Angebote bereitzustellen. Der anderen Hälfte wurde gesagt, dass dies nicht geschehe. Die Ergebnisse duplizieren das Kreuzmuster der ersten Studie, allerdings nur für die Niedrige-Privatheit-Bedingung. Das Muster kehrt sich für die Hohe-Privatheit-Kondition um. Signifikante 3-Wege-Interaktionen wurden für Wahrnehmung von Kontrolle und wahrgenommene Verbraucherfreundlichkeit gefunden. Schlüsselbegriffe: Kundenorientierung, Personalisierung, Agentschaft, Vielnutzung, Privatheit, wahrgenommene Kontrolle, wahrgenommene Verbraucherfreundlichkeit, Online-Nachrichten, Gatekeeping, Portal Adaptation ou personnalisation : L'importance de l'agentivité, de la confidentialité et de l'intensité de l'utilisation Résumé Cet article fait état de deux études. La première a présentéà de grands utilisateurs et à des utilisateurs réguliers un site web agrégateur de nouvelles qui était adaptéà l'utilisateur (conçu par le système), personnalisé (façonné par l'utilisateur lui-même) ou qui n'était ni l'un ni l'autre. Les résultats révèlent une interaction asymétrique en ce que les grands utilisateurs notaient plus favorablement la qualité du contenu lorsque le site avait une interface personnalisée, alors que les utilisateurs réguliers préféraient le contenu adapté. Dans la seconde étude, la moitié des participants ont été avisés que l'information sur leur navigation pourrait être utilisée afin de leur offrir les services demandés, alors que l'autre moitié a été avisée que cette information ne serait pas utilisée. Les résultats montrent que le modèle asymétrique révélé dans la première étude ne s'observait que sous les conditions de faible confidentialité, alors que le rapport s'inversait dans le contexte de forte confidentialité. Des interactions triangulaires significatives ont été démontrées pour le sentiment de contrôle et pour le sentiment de commodité. Mots clés : adaptation, personnalisation, agentivité, grands utilisateurs, vie privée, sentiment de contrôle, sentiment de commodité, nouvelles en ligne, portail La Personalización versus la Adaptación al Cliente La Importancia de la Agencia, la Privacidad, y el Uso del Poder Resumen Este manuscrito presenta dos estudios. El estudio 1 expuso a los usuarios de poder, así como a los usuarios regulares a una página agregada de noticias de Internet que estuvo ó personalizada (adaptada al sistema), ó adaptada al cliente (adaptada al usuario), ó a ninguna de las dos. Los hallazgos revelaron una interacción de cruce tal que los usuarios con poder estimaron al contenido como de mayor calidad cuando tenían una interfaz adaptada al usuario, mientras que los usuarios sin poder prefirieron el contenido personalizado. En el estudio 2, se les dijo a la mitad de los participantes que la forma en la que buscaban información podría ser usada para proveer los servicios solicitados mientras que a la otra mitad se le dijo que no sería usada. Los resultados revelaron que la pauta de cruzamiento encontrada en el estudio 1 fue observada solo en condiciones de privacidad baja, mientras que la pauta fue reversa bajo las condiciones de privacidad alta. Las interacciones significativas de 3 partes fueron encontradas para el sentido del control y la percepción de la conveniencia. Palabras Claves: Adaptado al cliente, personalización, agencia, poder de uso, privacidad, control percibido, percepción de conveniencia, noticias online, guardián, portal. [source]

    Effect of Sodium Chloride Salinity on Seedling Emergence in Chickpea

    JOURNAL OF AGRONOMY AND CROP SCIENCE, Issue 3 2002
    H. A. Esechie
    Although laboratory (Petri dish) germination as an estimate of seed viability is a standard practice, it may not give an accurate prediction of seedling emergence in the field, especially when saline irrigation water is used. Experiments were conducted to investigate seedling emergence in two chickpea cultivars (ILC 482 and Barka local) in response to varied salinity levels and sowing depths. Seeds were sown in potted soil at a depth of 2, 4 or 6 cm. The salinity treatments were 4.6, 8.4 and 12.2 dS m,1. Tap water (0.8 dS m,1) served as the control. Depth of sowing had a significant effect on seedling emergence. Seeds sown 6 cm deep showed the lowest seedling emergence. Similarly, salinity had an adverse effect on seedling emergence. The lowest seedling emergence percentages were obtained at the highest salinity treatment (12.2 dS m,1). The interaction between salinity treatment and seeding depth was significant. Hypocotyl injury was implicated as a possible cause of poor seedling emergence in chickpea under saline water irrigation and was less severe when pre-germinated seeds were used. ILC 482 appeared to be more tolerant to salinity than Barka local, suggesting that breeding programmes involving regional exchange of germplasm may be helpful. Einfluss einer Natriumchloridversalzung auf den Sämlingsaufgang von Kichererbse Obwohl im Laboratorium (Petrischale) die Keimung an Hand einer Abschätzung der Samenkeimkraft als Standard beurteilt wird, kann dies eine nicht zuverlässige Voraussage des Sämlingsaufganges im Feld sein, insbesondere wenn versalztes Bewässerungswasser verwendet wird. Die Experimente wurden durchgeführt, um das Sämlingsauflaufen von zwei Kichererbsenkultivaren (ILC 482 und Barka local) in der Reaktion gegenüber variierten Versalzungskonzentrationen und Aussaattiefen zu untersuchen. Die Samen wurden in Gefäßkulturen mit einer Tiefe von 2, 4 oder 6 cm angesät. Die Versalzungsbehandlungen betrugen 4.6, 8.4 und 12.2 dS m,1. Unversalztes Wasser (0.8 dS m,1) diente als Kontrolle. Die Aussaattiefe hatte einen signifikanten Einfluss auf das Auflaufen der Sämlinge. Samen mit einer 6 cm Tiefe Ansaat hatten den schlechtesten Auflauf. Entsprechend zeigte auch die Versalzung einen ungünstigen Einfluss auf den Sämlingsaufgang. Die schlechteste Keimlingsaufgangsrate wurde bei der höchsten Versalzungsbehandlung (12.2 dS m,1) gefunden. Die Interaktion zwischen Versalzungsbehandlungen und Saattiefe war signifikant. Die Hypokotytbeschädigung wird als eine mögliche Ursache der schwachen Auflaufraten bei Kichererbse unter dem Einfluss versalzten Bewässerungswassers erklärt; die Wirkung war weniger schwer, wenn vorgekeimte Samen verwendet wurden. ILC 482 scheint toleranter gegenüber Versalzung zu sein als Barka local; es erscheint zweckmäßig, Zuchtprogramme unter Verwendung regionaler Genotypen durchzuführen. [source]

    Sensitivity of Crops to Increased Ultraviolet Radiation in Northern Growing Conditions

    JOURNAL OF AGRONOMY AND CROP SCIENCE, Issue 1 2002
    K. Hakala
    Crops growing at high latitudes are adapted to low intensities of solar ultraviolet B radiation (UV-B). As a result of destruction of stratospheric ozone layer especially at the Polar Regions of the globe, the intensity of UV-B is projected to increase at high latitudes. In order to find out the consequences of increased UV-B on crops, the sensitivity of different varieties of barley, wheat, oats, clover, timothy, meadow fescue, tall fescue and potato was tested in Jokioinen, Finland. The experiment was conducted in the field, under natural light, with a continuous 30 % increase in UV-B. Both increased UV-B and the control with slightly increased UV-A radiation affected the number of lateral shoots in cereals, and the specific leaf area and the content of phenolic substances in grasses. The effects varied according to plant variety and time of growing season. However, no visible damage, nor changes in biomass and yield production were found in any of the crops. Long-term effects on, e.g. genetic stability and germination of crop seed remain to be studied. Empfindlichkeit von Kulturpflanzenbeständen gegenüber einer Erhöhung der ultravioletten Einstrahlung unter nördlichen Wachstumsbedingungen Kulturpflanzenbestände, die unter hohen Breitengraden wachsen, sind an geringe Intensitäten der solaren ultravioletten B Einstrahlung (UV-B) angepasst. Aufgrund der Destruktion der Stratosphäre, insbesondere der Ozonschicht, im Bereich der polaren Gebiete der Erde, ist eine zunehmende Intensität der UV-B Strahlung in hohen Breitengraden festzustellen. Um die Konsequenzen einer Erhöhung von UV-B auf Kulturpflanzenbestände zu bestimmen, wurde die Empfindlichkeit unterschiedlicher Arten wie Gerste, Weizen, Hafer, Klee, Wiesenlieschgras, Wiesenschwingel, Rohrschwingel und Kartoffel in Jokioinen, Finnland, untersucht. Das Experiment wurde im Felde durchgeführt unter natürlichen Lichtbedingungen mit einer kontinuierlichen Zunahme von 30 % für UV-B. Sowohl eine Erhöhung der UV-B als auch die Kontrolle mit leicht erhöhten UV-B Strahlungen beeinflussten die Anzahl der Nebenwurzeln bei den Getreidepflanzen und die spezifische Blattfläche sowie den Gehalt an phenolischen Substanzen bei den Gräsern. Die Wirkungen variierten entsprechend der Pflanzenvarietät und der Anbauzeit. Allerdings wurden keine erkennbare Schädigungen noch Änderungen in der Biomasse und in der Ertragsproduktion bei einer der untersuchten Pflanzenbestände gefunden. Langzeitwirkungen auf die genetische bedingte Stabilität und Keimung der Kulturpflanzen sollte weiterhin untersucht werden. [source]

    Effects of Salinity and Mixed Ammonium and Nitrate Nutrition on the Growth and Nitrogen Utilization of Barley

    JOURNAL OF AGRONOMY AND CROP SCIENCE, Issue 4 2001
    A. Ali
    The absorption and utilization of nitrogen (N) by plants are affected by salinity and the form of N in the root medium. A hydroponic study was conducted under controlled conditions to investigate growth and N uptake by barley (Hordeum vulgare L.) supplied with five different NH4+ -N/NO3, -N ratios at electrical conductivity of 0 and 8 dS m,1. The five NH4+ -N/NO3 -N ratios were 0/100, 25/75, 50/50, 75/25 and 100/0, each giving a total N supply of 100 mg N l,1 in the root medium. A mixed N supply of NH4+ and NO3, resulted in greater accumulation of N in plants than either NO3, or NH4+ as the sole N source. Plants produced a significantly higher dry matter yield when grown with mixed N nutrition than with NH4+ or NO3, alone. Total dry matter production and root and shoot N contents decreased with increasing salinity in the root medium. The interaction between salinity and N nutrition was found to be significant for all the variables. A significant positive correlation (r=0.97) was found between nitrogen level in the plant shoot and its dry matter yield. Wachstum und Stickstoffausnutzung bei Gerste in Abhängigkeit von Versalzung und Michungen von Ammonium und Nitrat Aufnahme und Nutzung von N durch Pflanzen wird von der Versalzung und N-Form im Wurzelbereich bestimmt. Es wurde in Hydrokultur unter kontrollierten Bedingungen Wachstum und N-Aufnahme durch Gerste (Hordeum vulgare L.) bei Anwendung von fünf unterschiedlichen NH4+ -N/NO3, -N Verhältnissen bei einer elektrischen Konduktivität von 0 und 8 dS m,1 untersucht. Die Gesamtmenge von 100 mg N l,1 im Wurzelmedium wies NH4+ -N/NO3, -N Verhältnisse von 0/100, 25/75, 50/50, 75/25 und 100/0 auf. Mischungen von NH4+ und NO3, führten zu einer größeren Aufnahme durch die Pflanzen als bei alleiniger Anwendung von NO3, oder NH4+. Die Pflanzen produzierten signifikant mehr Gesamttrockenmasse mit Mischungen der beiden N-Formen im Vergleich zu alleiniger Anwendung von NH4+ oder NO3,. Die Gesamttrockenmasse sowie die N-Gehalte von Wurzel und Sproß nahmen mit steigender Versalzung ab. Versalzungs- und N-Versorgungs-Interaktion war signifikant in allen Versuchsbedingungen. Eine signifikante positive Korrelation (r=0,97) wurde zwischen Stickstoffkonzentration und der Trockenmasseproduktion der Pflanze gefunden. [source]

    Effects of Interactions of Moisture Regime and Nutrient Addition on Nodulation and Carbon Partitioning in Two Cultivars of Bean (Phaseolus vulgaris L.)

    JOURNAL OF AGRONOMY AND CROP SCIENCE, Issue 4 2001
    T. Boutraa
    Major limitations of bean (Phaseolus vulgaris L.) production in arid and semiarid regions are lack of moisture and low soil fertility. An experiment was conducted to determine the effects of soil moisture and N : P : K (20 : 10 : 10) fertilizer on root and shoot growth of two cultivars of bean: cv. Carioca, an indeterminate Brazilian landrace, and cv. Prince, a determinate cultivar grown in Europe. Carioca appears generally stress-tolerant while Prince is intolerant. Seedlings were grown in pots of non-sterile soil at 30, 60 or 90 % field capacity (FC), and given 0, 0.1 or 1 g (kg soil),1 of compound fertilizer. The soil contained a population of effective Rhizobium. Growth of both cultivars was greatest in the high moisture and high nutrient treatments. Root fractions were highest at low nutrient supply; the effect of water was not significant. Leaf fraction decreased as root fraction increased. Numbers of nodules were highest at high and intermediate moisture when no fertilizer was applied. Numbers were lowest at 30 % FC and at the highest fertilizer rate. Masses of nodules and fractions followed the same pattern. Decreasing water regime reduced the relative growth rate (RGR) of Prince, while Carioca maintained high RGR at unfavourable conditions of water and nutrients. Net assimilation rates (NAR) were unaffected by nutrient addition, and reduced by low moisture regime. Water use efficiencies (WUEs) were reduced by water stress but increased by nutrient deficiency. The water utilization for dry matter production was optimal at 60 % FC. Einflüsse der Interaktionen von Bodendenfeuchte und Düngung auf die Knöllchenbildung und Kohlenstoff verteilung bei zwei Bohnenkultivaren (Phaseolus vulgaris L.) Der begrenzende Hauptfaktor der Bohnenproduktion in ariden und semiariden Regionen sind der Feuchtigkeitsmangel und die Bodenfruchbarkeit. Es wurde ein Experiment durchgeführt, um die Wirkungen des Bodenwassers und von N : P : K (20 : 10 : 10) Dünger auf das Wurzel- und Sproßwachstum an zwei Kultivaren von Bohnen (Phaseolus vulgaris L. cv. Carioca, eine brasilianischen, indeterminierte Landsorte und cv. Prince, eine determinierter in Europa angebauter Kultivar) zu untersuchen. Carioca erscheint grundsätzlich streßtoleranter im Vergleich zu Prince. Die Sämlinge wurden in Gefäßen mit nichtsterilisiertem Boden unter Feldkapazitäten von 30,60 oder 90 % mit 0, 0,1 oder 1 g eines Volldüngers angezogen. Der Boden enthielt eine Population von wirksamem Rhizobium. Das stärkste Wachstum wurde bei beiden Kultivaren unter dem Einfluß des höchsten Feuchtigkeitsgehaltes und der höchsten Düngermenge gefunden. Der Wurzelanteil war bei der geringen Düngermenge am niedrigsten. Der Einfluß der Bodenfeuchtigkeit war nicht signifikant. Der Blattanteil nahm mit zunehmendem Wurzelanteil ab. Die Anzahl der Knötchen war bei hoher und mittlerer Bodenfeuchte und ohne Düngeranwendung am höchsten. Die Anzahl war am geringsten bei 30 % FC und der höchsten Düngermenge. Die Knötchenmasse und ihr Anteil reagierte entsprechend. Abnehmende Bodenfeuchte reduzierte die relative Wachtumsrate (RGR) von Prince, während Carioca einen hohen RGR auch bei ungünstigen Bedingungen bezüglich Wasser und Düngung behielt. Die Nettoassimilationsraten wurden durch die Düngung nicht beeinflußt; sie gingen bei geringer Bodenfeuchte zurück. Die Wassernutzungseffiziens (WUE) wurde bei Wasserstreß reduziert, nahm aber bei Düngermangel zu. Die Wassernutzung für die Trockenmasseproduktion war bei 60 % Feldkapazität am höchsten. [source]

    A comparison of restricted selection procedures to control genetic gains

    JOURNAL OF ANIMAL BREEDING AND GENETICS, Issue 2 2004
    S. Ieiri
    Summary Using Monte Carlo simulation, two schemes of restricted selection were compared under various combinations of genetic parameters and constraints on the genetic gains. The first selection scheme is the combination of best linear unbiased prediction (BLUP) evaluation and linear programming technique (BLUP + LP), and the second one is based on the restricted BLUP selection (RBLUP). Selection for two traits was supposed, in which animals were selected to maximize the genetic gain in trait 2 (,g2) under a proportional restriction on the genetic gain in trait 1 (,g1) to satisfy the intended ratio (,g1:,g2). Little differences were found between the two selection schemes with respect to the genetic gains averaged over replicates. However, in all the cases studied, the variance of genetic gains among replicates under BLUP + LP selection was smaller and less sensitive to the genetic parameters and the intended restriction than RBLUP selection. Under the situations of antagonistic selection, the difference tended to be larger. When the heritabilities of the two traits were different, RBLUP selection remarkably increased the variance of genetic gain in a trait with a higher heritability. These results suggest that BLUP + LP selection should always be preferable to RBLUP selection because of the smaller risk of selection. This choice is especially important for the situation where the genetic parameters act as limiting factors for the achievement of intended genetic gains. Zusammenfassung Unter Verwendung von Monte Carlo Simulation wurden zwei verschiedene Selektionsstrategien mit verschiedenen Kombinationen genetischer Parameter und Beschränkungen des genetischen Fortschritts verglichen. Die erste Selektionsstrategie stellt eine Kombination von BLUP-Schätzung und linearer Programmiertechnik (BLUP + LP) dar, die zweite Strategie basiert auf einer reduzierten BLUP-Selektion (RBLUP). Die Selektion wurde auf zwei Merkmalen basierend durchgeführt in welchen Tiere ausgewählt wurden, um den genetischen Fortschritt in Merkmal 2 zu maximieren (,g2) unter proportionaler Restriktion des genetischen Fortschritts in Merkmal 1 (,g1), um die beabsichtigte Beziehung zu erreichen (,g1:,g2). Kleine Unterschiede wurden zwischen den beiden Selektionsstrategien in Bezug auf den mittleren genetischen Fortschritt über Wiederholungen gefunden. Wie auch immer, in allen untersuchten Fällen war die Varianz des genetischen Fortschritts zwischen Wiederholungen mit der BLUP + LP-Selektion geringer und weniger abhängig in Bezug auf die genetischen Parameter und die beabsichtigte Restriktion im Vergleich zur RBLUP-Selektion. Unter den Gegebenheiten der gegenläufigen Selektion schien der Unterschied größer zu werden. Wenn die Heritabilitäten der beiden Merkmale unterschiedlich waren, stieg die Varianz des genetischen Fortschritts bei RBLUP in einem Merkmal mit höherer Heritabilität außergewöhnlich. Diese Ergebnisse deuten an, dass BLUP + LP-Selektion gegenüber RBLUP aufgrund des geringeren Selektionsrisikos stets bevorzugt werden sollte. Diese Wahl ist vornehmlich wichtig für die Situation, in der die genetischen Parameter ein limitierender Faktor zur Erreichung von genetischem Fortschritt sind. [source]

    Genome-wide linkage and QTL mapping in porcine F2 families generated from Pietrain, Meishan and Wild Boar crosses

    JOURNAL OF ANIMAL BREEDING AND GENETICS, Issue 6 2003
    H. Geldermann
    Summary Three informative pig F2 families based on European Wild Boar (W), Meishan (M) and Pietrain (P) crosses have been used for genome-wide linkage and quantitative trait loci (QTL) analysis. Altogether 129 microsatellites, 56 type I loci and 46 trait definitions (specific to growth, fattening, fat deposition, muscling, meat quality, stress resistance and body conformation) were included in the study. In the linkage maps of M × P, W × P and W × M families, average spacing of markers were 18.4, 19.7 and 18.8 cM, the numbers of informative meioses were 582, 534 and 625, and the total lengths of autosomes measured were 27.3, 26.0 and 26.2 Morgan units, respectively. Maternal maps were on average 1.3 times longer than paternal maps. QTLs contributing more than 3% of F2 phenotypic variance could be identified at p < 0.05 chromosome-wide level. Differences in the numbers and positions of QTLs were observed between families. Genome-wide significant QTL effects were mapped for growth and fattening traits on eight chromosomes (1, 2, 4, 13, 14, 17, 18 and X), for fat deposition traits on seven chromosomes (1, 2, 3, 4, 6, 7 and X), for muscling traits on 11 chromosomes (1, 2, 3, 4, 6, 7, 8, 12, 14, 15 and X), for meat quality and stress resistance traits on seven chromosomes (2, 3, 6, 13, 16, 18 and X), and QTLs for body-conformation traits were detected on 14 chromosomes. Closely correlated traits showed similar QTL profiles within families. Major QTL effects for meat quality and stress resistance traits were found on SSC6 in the interval RYR1-A1BG in the W × P and M × P families, and could be attributed to segregation of the RYR1 allele T derived from Pietrain, whereas no effect in the corresponding SSC6 interval was found in family W × M, where Wild Boar and Meishan both contributed the RYR1 allele C. QTL positions were mostly similar in two of the three families for body conformation traits and for growth, fattening, fat deposition and muscling traits, especially on SSC4 (interval SW1073-NGFB). QTLs with large effects were also mapped on SSC7 in the major histocompatibility complex (MHC) (interval CYP21A2-S0102) and affected body length, weight of head and many other traits. The identification of DNA variants in genes causative for the QTLs requires further fine mapping of QTL intervals and a positional cloning. However, for these subsequent steps, the genome-wide QTL mapping in F2 families represents an essential starting point and is therefore significant for animal breeding. Zusammenfassung Drei informative F2 -Familien, die aus Kreuzungen von Europäischem Wildschwein (W), Meishan (M) und Pietrain (P) erstellt worden waren, wurden für eine genomweite Kopplungs- und QTL-Analyse benutzt. Insgesamt wurden 129 Mikrosatellitenloci, 56 Type-I-Loci und 46 Merkmalsdefinitionen (für Wachstum, Mastleistung, Fettansatz, Bemuskelung, Fleischqualität, Stressresistenz und Körperform) in die Untersuchungen einbezogen. In den Kopplungskarten der Familien M × P, W × P und W × M wurden durchschnittliche Markerabstände von 18.4, 19.7 bzw. 18.8 cM erreicht und 582, 534 bzw. 625 informative Meiosen beobachtet. Für die Gesamtlängen der Autosomen wurden in den drei Familien 27.3, 26.0 bzw. 26.2 Morgan-Einheiten gemessen. Die maternalen Kopplungskarten waren durchschnittlich 1.3-fach länger als die paternalen. QTLs, die mehr als 3% der phänotypischen Varianz in der F2 -Generation erklärten, konnten mit p < 0.05 chromosomenweitem Signifikanzniveau nachgewiesen werden. Zwischen den Familien wurden Differenzen in den Anzahlen und Positionen der QTLs beobachtet. Genomweit signifikante QTL-Effekte wurden für Wachstum und Fettansatz auf acht Chromosomen (1, 2, 4, 13, 14, 17, 18 und X) kartiert, für Fettansatz auf sieben Chromosomen (1, 2, 3, 4, 6, 7 und X), für Bemuskelung auf elf Chromosomen (1, 2, 3, 4, 6, 7, 8, 12, 14, 15 und X), für Fleischqualität/Stressresistenz auf sieben Chromosomen (2, 3, 6, 13, 16, 18 und X), und QTLs für die Körperform wurden auf 14 Chromosomen kartiert. Eng korrelierte Merkmale zeigten ähnliche QTL-Profile innerhalb Familien. Die bedeutsamsten QTL-Effekte wurden für Fleischqualitäts- und Stressresistenzmerkmale auf Chromosom 6, Intervall RYR1-A1BG, in den Familien W × P und M × P gefunden, während in diesem Chromosomenintervall in der Familie W × M, in der der RYR1 -Locus keine segregierenden Exon-Allele aufwies, kein QTL zu erkennen war. Mehrere der QTL-Positionen waren für die Körperform wie auch für Wachstum, Mastleistung, Fettansatz und Bemuskelung in zwei von drei Familien ähnlich. Dies galt besonders für Chromosom 4 (Intervall SW1073-NGFB). QTLs mit großen Effekten wurden auf Chromosom 7 im MHC (Intervall CYP21A2-S0102) kartiert; sie beeinflussten Körperlänge, Kopfgewicht, aber auch viele weitere Merkmale. Zur Identifizierung der DNA-Varianten, die einem QTL zugrunde liegen, ist eine Feinkartierung von QTLs und positionale Klonierung erforderlich. Für diese nachfolgenden Untersuchungsmethoden ist jedoch die genomweite QTL-Kartierung in F2 -Familien ein entscheidender Ausgangspunkt; sie ist deshalb bedeutungsvoll für die Tierzüchtung. [source]

    Application of REML procedure to estimate the genetic parameters of weekly liveweights in one-to-one sire and dam pedigree recorded Japanese quail

    JOURNAL OF ANIMAL BREEDING AND GENETICS, Issue 1 2003
    M. Saatci
    Summary Residual maximum likelihood procedure was applied to analyse data from a one-to-one pedigreed Japanese quail population, using an animal model to estimate the genetic parameters of weekly liveweights. Records of 1108 animals from 113 sires and 152 dams were analysed. An individual animal model was used. The heritabilities of weights for hatching (HW) with their standard errors (SE), week 1 (W1), week 2 (W2), week 3 (W3), week 4 (W4), week 5 (W5) and week 6 (W6) were 0.51 ± 0.05, 0.32 ± 0.06, 0.20 ± 0.05, 0.21 ± 0.06, 0.20 ± 0.05, 0.15 ± 0.04 and 0.14 ± 0.04, respectively. The strongest genetic correlations were found between W1 and W3 (0.98 ± 0.11). Generally, genetic correlations were higher than the phenotypic correlations. The highest phenotypic correlation (0.85) was between the W4 and W5 weights. Strong genetic correlations among the weekly weights suggest that selection for W5 or W6 weight may be based on weights recorded earlier. Zusammenfassung Die Anwendung der REML-Methode zur Schätzung von genetischen Parametern für Wochengewichte bei japanischen Wachteln mit Abstammungsinformationen Die REML-Methode zur Varianzkomponentenschätzung mittels eines Tiermodells wurde für eine Population von japanischen Wachteln mit Abstammungsinformationen für Wochengewichte angewandt. Daten von 1108 Tieren von 113 Vätern und 152 Müttern wurden mit einem Tiermodell analysiert. Folgende Heritabilitäten wurden geschätzt: 0,51 ± 0,05 für Schlupfgewicht (HW), 0,32 ± 0,06 für Gewicht 1. Woche (W1), 0,20 ± 0,05 für Gewicht 2. Woche (W2), 0,21 ± 0,06 für Gewicht 3. Woche (W3), 0,20 ± 0,05 für Gewicht 4. Woche (W4), 0,15 ± 0,04 für Gewicht 5. Woche (W5) und 0,14 ± 0,04 für Gewicht 6. Woche (W6). Die höchste genetischen Korrelation wurde zwischen W1 und W3 gefunden (0,98 ± 0,11). Generell waren die genetischen Korrelationen höher als die phänotypischen. Die höchste phänotypische Korrelation (0,85) wurde zwischen den Gewichten in der 4. und 5. Woche beobachtet. Die hohen genetischen Korrelationen führen zu der Konsequenz, dass auf die Gewichte der 5. und 6. Woche selektiert werden kann unter Nutzung der früheren Wochengewichte. [source]

    Effective size of populations with unequal sex ratio and variation in mating success

    JOURNAL OF ANIMAL BREEDING AND GENETICS, Issue 5 2002
    T. Nomura
    Summary To estimate the effective size (Ne) of populations with unequal sex ratio, a well-known formula, Ne=4NmNf/(Nm + Nf), has been frequently used, where Nm and Nf are the numbers of male and female parents, respectively. In this paper, the formula was examined under typical mating systems in animals. It was shown that the formula holds only when there are no variations in the numbers of mates (mating success) of parents of each sex. More appropriate equations were developed by accounting for the variation in mating success. It was found that for animal populations with harem mating system, an equation Ne=4NmNf/(2Nm+Nf) gives a more accurate estimate than the well-known formula. The effective population sizes of several wild, experimental and domestic animals are estimated by applying the derived equations to the published demographic and ecological data. Zusammenfassung Effektive Größe von Populationen mit ungleichem Geschlechterverhältnis und Variation im Anpaarungserfolg Zur Schätzung der effektiven Populationsgröße (Ne) mit ungleichem Geschlechterverhältnis, wurde häufig die allgemein bekannte Formel Ne=4NmNf/(Nm + Nf) verwendet, wobei Nm und Nf die Anzahl männlicher und weiblicher Eltern bezeichnen. In diesem Artikel wurde diese Formel unter verschiedenen Anpaarungssystemen überprüft. Es wurde gezeigt, daß die Formel nur zutrifft, wenn die Anzahl der angepaarten Tiere (Anpaarungserfolg) in jedem Geschlecht nicht variieren. Es wurden genauere Gleichungen entwickelt, die den Anpaarungserfolg mitberücksichtigen. Für Tierpopulationen mit Harempaarung wurde die Gleichung Ne=4NmNf/(2Nm + Nf) als genauerer Schätzer als die allgemein bekannte Formel gefunden. Die effektive Populationsgröße mehrerer Wild-, Versuchs- und Haustierpopulationen wurden mittels der abgeleiteten Gleichung und demographischen und ökologischen Daten geschätzt. [source]

    Genetic variances due to imprinted genes in cattle

    JOURNAL OF ANIMAL BREEDING AND GENETICS, Issue 3 2002
    TH. ENGELLANDT
    The effect of paternally expressed, i.e. maternally imprinted, genes on slaughter records from 2744 German Gelbvieh finishing bulls were estimated. Significant effects of paternal gametes were found for two fatness traits and an estimate of meat content. Paternally expressed genes explained 14 and 16% of the phenotypic variances for pelvic fat and kidney fat, respectively. Ignoring paternal gametic effects resulted in inflated estimates of the additive genetic variances. The heritabilities of pelvic and kidney fat dropped from 0.31 to 0.16 and from 0.59 to 0.28, respectively, when paternal gametes were fitted. A 15% influence of paternally expressed genes and a reduction in heritability of 20% were also found for estimated meat content. Simulation studies demonstrated that the uncorrelated random effect of the sire is a useful indicator for the presence of paternal gametic effects in variance component estimations. The presented results correspond well with findings in swine, where a paternally expressed QTL at the Igf2 gene influences similar trait complexes. A viable speculation could therefore be that an imprinted bovine Igf2 gene caused the effects described here. Genetische Variation auf Grund von paternal exprimierten Genen beim Rind In der vorliegenden Studie wurde der Effekt von paternal exprimierten Genen auf Merkmale der Schlachtleistung und des Schlachtkörperwertes von 2744 Mastbullen der Rasse Gelbvieh geschätzt. Signifikante Effekte von paternal exprimierten Genen wurden für zwei Fettabschnitte des Schlachtkörpers und für den geschätzten Fleischanteil gefunden, sie erklärten 14% und 16% der phänotypischen Varianzen des Becken- und Nierenfettes. Das Nichtbeachten dieser Effekte im linearen Schätzmodell führte zu einer Überschätzung der additiv genetischen Varianzen in den jeweiligen Merkmalen. Wurden die Effekte der paternalen Gameten im Schätzmodell berücksichtigt, fielen die geschätzten Heritabilitäten des Becken- und Nierenfettes von h2=0,31 auf h2=0,16 bzw. von h2=0,59 auf h2=0,28. Der Einfluß der paternalen Gameten auf die phänotypische Varianz des geschätzten Fleischanteils des Schlachkörpers wurde auf 15% geschätzt. Bei Berücksichtigung dieser Effekte im linearen Schätzmodell fiel die Heritabilität des Merkmals Fleischanteil um 20%. In Simulationsstudien konnte gezeigt werden, daß der unkorrelierte, zufällige Effekt des Vaters ein nützlicher Indikator für eventuell vorhandene paternal gametische Effekte bei der Schätzung von Varianzkomponenten sein kann. Die gefundenen Ergebnisse weisen Parallelen zu Untersuchungen beim Schwein auf, wo ein paternal exprimierter QTL am Igf2 Locus ähnliche Merkmalskomplexe beeinflußt. Eine mögliche Spekulation könnte daher sein, daß die hier beschriebenen Effekte beim Rind durch einen Igf2 Locus verursacht werden, der dem Phänomen des Imprinting unterliegt. [source]

    Genetic structure of Norwegian horse breeds

    JOURNAL OF ANIMAL BREEDING AND GENETICS, Issue 5 2000
    G. Bjørnstad
    The evaluation of the genetic structure of four native Norwegian horse breeds was investigated using 35 genetic markers including nine biochemical loci and 26 microsatellites. The proportion of genetic variation measured as heterozygosity and the number of alleles indicated high variation in Fjord Horse and Coldblooded Trotter, but somewhat reduced variation in Døle Horse. No clear signs of bottleneck effects were found in either of the breeds, but significant inbreeding estimates in Nordland/Lyngen Horse may indicate subdivision of this breed. Significant population differentiation was detected between all breeds, also between the recently diverged Døle Horse and Coldblooded Trotter. The principal component analysis supports the close genetic relationship between these two breeds. Zusammenfassung Die genetische Struktur von vier in Norwegen heimischen Pferderassen wurde mit Hilfe von 35 genetischen Markören bestehend aus neun biochemischen Loci und 26 Mikrosatelliten untersucht. Der Umfang der genetischen Variation, gemessen als Heterozygozität und Anzahl Allelen, deutet eine grosse Variation beim Norwegischen Fjordpferd und Kaltbluttraber an, aber eine geringere beim Dölepferd. In keine der Rassen wurden klare Anzeichen eines Flaschenhalseffektes gefunden, aber hohe Inzuchtschätzwerte des Nordland/Lyngenpferdes lassen eine Unterteilung dieser Rasse vermuten. Zwischen allen Rassen wurde signifikante Populationsunterschiede gefunden, auch zwischen den erst neulich getrennten Dölepferd und Kaltbluttraber. Die enge genetische Beziehung zwischen diesen beiden Rassen wird durch die Hauptkomponentenanalyse unterstützt. [source]

    Genetic parameters for individual birth and weaning weight and for litter size of Large White pigs

    JOURNAL OF ANIMAL BREEDING AND GENETICS, Issue 3 2000
    D. Kaufmann
    Summary Data from a French experimental herd recorded between 1990 and 1997 were used to estimate genetic parameters for individual birth and weaning weight, as well as litter size of Large White pigs using restricted maximum likelihood (REML) methodology applied to a multivariate animal model. In addition to fixed effects the model included random common environment of litter, direct and maternal additive genetic effects. The data consisted of 1928 litters including individual weight observations from 18151 animals for birth weight and from 15360 animals for weaning weight with 5% of animals transferred to a nurse. Estimates of direct and maternal heritability and proportion of the common environmental variance for birth weight were 0.02, 0.21 and 0.11, respectively. The corresponding values for weaning weight were 0.08, 0.16 and 0.23 and for litter size 0.22, 0.02 and 0.06, respectively. The direct and the maternal genetic correlations between birth and weaning weight were positive (0.59 and 0.76). Weak positive (negative) genetic correlations between direct effects on weight traits and maternal effects on birth weight (weaning weight) were found. Negative correlations were found between direct genetic effect for litter size and maternal genetic effects on all three traits. The negative relationship between litter size and individual weight requires a combined selection for litter size and weight. Zusammenfassung Daten einer französischen Versuchsherde aus den Jahren 1990 bis 1997 wurden für die Schätzung von genetischen Parametern für individuelles Geburts-, Absetzgewicht und Wurfgrösse bei französischen Large White verwendet. Die Schätzung der Parameter erfolgte mit der Restricted Maximum Likelihood Methode (REML) angewandt auf ein multivariates Tiermodell. Neben fixen Effekten berücksichtigte das Modell die zufällige gemeinsame Wurfumwelt und direkte und maternale additiv genetische Effekte. Der Datensatz bestand aus 1928 Wurfaufzeichnungen mit Angaben zum individuellen Geburtsgewicht von 18151 Tieren und zum Absetzgewicht von 15360 Tieren. Nach der Geburt wurden 5% der Ferkel in einen anderen Wurf versetzt. Die geschätzten Werte für die direkte, die maternale Heritabilität und den Varianzanteil der Wurfumwelt waren für das Geburtsgewicht 0.02, 0.21 und 0.11. Die entsprechenden Werte für das Absetzgewicht waren 0.08, 0.16 und 0.23 und für die Wurfgrösse 0.22, 0.02 und 0.06. Die direkten und die maternalen genetischen Korrelationen zwischen Geburts-und Absetzgewicht waren positiv (0.59 und 0.76). Schwache positive (negative) genetische Korrelationen wurden zwischen den direkten genetischen Effekten auf die Gewichtsmerkmale und dem maternalen genetischen Effekt auf das Geburtsgewicht (Absetzgewicht) gefunden. Negative Korrelationen gab es zwischen dem direkten genetischen Effekt auf die Wurfgrösse und den maternalen genetischen Effekten auf alle drei Merkmale. Die negative Beziehung zwischen Wurfgrösse und individuellem Gewicht verlangt nach einer kombinierten Selektion für Wurfgrösse und Gewicht. [source]

    Longitudinal evaluation of GCF IFN-, levels and periodontal status in HIV+ patients

    JOURNAL OF CLINICAL PERIODONTOLOGY, Issue 11 2003
    T. Alpagot
    Abstract Background/Aim: Loss of periodontal support and related tooth loss is a common finding among HIV+ patients. The etiology of this destruction may be an increase in the levels of pro-inflammatory cytokines and subsequent increase in periodontal disease activity. The purpose of this study was to investigate the associations between gingival crevicular fluid interferon gamma (GCF IFN- ,) and clinical measures of periodontal disease in HIV+ individuals. We monitored GCF IFN- , and periodontal status of selected sites in 33 HIV+ subjects over a 6-month period. Method: Clinical measurements including gingival index, plaque index, bleeding on probing, probing depth, attachment loss (AL), and GCF samples were taken from four lower incisors and the upper right posterior sextant of each patient at baseline and 6-month visits by means of sterile paper strips. GCF levels of IFN- , were determined by sandwich ELISA assays. A progressing site was defined as a site that had 2 mm or more AL during the 6-month study period. Results: Twenty-five of the 264 examination sites showed 2 mm or more clinical AL during the 6-month study period. Significantly higher GCF levels of IFN- , were found at progressing sites than in nonprogressing sites (p<0.001). GCF levels of IFN- , were highly correlated with clinical measurements taken at baseline and 6-month visits (0.001gefunden (p<0.001). Die GCF Level von IFN- , waren hoch korreliert mit den klinischen Messungen zur Basis und bei der 6Monatsvisite (0.001[source]

    Accumulation of methylglyoxal in the gingival crevicular fluid of chronic periodontitis patients

    JOURNAL OF CLINICAL PERIODONTOLOGY, Issue 4 2003
    S. Kashket
    Abstract Background, aims: Methylglyoxal (MG), a toxic product of cellular metabolism, is elevated in tissues and fluids in a number of human diseases. A cross-sectional study was undertaken to determine whether MG accumulates in the gingival crevicular fluid (GCF) of chronic periodontitis patients. Methods: GCF samples were collected for 30 s each from three teeth with pocket depths greater than 3 mm (DD sites), from 14 chronic periodontitis patients. Control samples were taken from three healthy sites (DH sites) in the same patients, as well as from seven subjects who were periodontally healthy (HH sites). Fluid volumes were determined and the strips were placed in 0.5 N perchloric acid. Subsequently, samples were derivatized with o -phenylenediamine and the resulting methylquinoxaline was assayed by high-performance liquid chromatography on Lichrospher® -100 RP-18, with UV detection. Results: Mean pocket depths were 5.7±0.7, 2.7±0.6 and 2.7±0.5 mm (mean±SD) for the DD, DH and HH sites, respectively. Mean MG levels were found to be 208.7±241.7 and 142.9±235.7 pmol/site in the GCF from DD and DH sites, respectively (p=0.0023), but only 11.5±4.4 pmol/site for the HH sites. Bacteroides forsythus has been found to accumulate high levels of MG in culture (unpublished data) and, consistent with this, the sampled diseased sites contained higher levels of B. forsythus than the corresponding healthy sites (2.7±4.2×105 versus 0.7±1.1×105, respectively; p=0.022). Total "red complex" microorganisms were significantly elevated in the DD sites. Conclusions: In view of the known protein- and DNA-modifying effects of MG, the finding of elevated levels of MG in the GCF from chronic periodontitis patients supports the hypothesis that MG may contribute to destructive tissue damage in this disease. Zusammenfassung Hintergrund: Methylglyoxal (MG), ein toxisches Produkt des Zellstoffwechsels, ist bei einer Reihe menschlicher Erkrankungen in Geweben und Körperflüssigkeiten erhöht. Zielsetzung: Querschnittsstudie zur Klärung der Frage, ob sich MG in der Sulkusflüssigkeit (SF) bei Patienten mit chronischer Parodontitis ansammelt. Methoden: Bei 14 Patienten mit chronischer Parodontitis wurde SF für 30 s an 3 Zähnen mit Sondierungstiefen >3 mm (DD-Stellen) gewonnen. Kontrollproben wurden von jeweils 3 gesunden Stellen (DH-Stellen) bei den gleichen Patienten und bei 7 parodontal gesunden Personen gewonnen (HH-Stellen). Die Flüssigkeitsvolumina wurden bestimmt und die Probenstreifen in 0,5 N Perchlorsäure gegeben. Anschließend wurden die Proben mit o-Phenyldiamin versetzt und das resultierende Methylquinoxalin wurde mittels High-Performance-Liquid-Chromatographie in einem Lichrospher®-100 RP-18 bei UV-Detektion nachgewiesen. Ergebnisse: Die mittleren Sondierungstiefen lagen bei 5,7±0,7, an den DD-Stellen, bei 2,7±0,6 (DH) und 2,7±0,5 mm (Mittelwert + Standardabweichung) (HH). Die mittleren MG-Spiegel lagen bei 208,7±241,7 an den DD-Stellen und bei 142,9±235,7 pmol/Stelle an den DH-Stellen (p=0,0023), aber nur bei 11,5±4,4 pmol/Stelle an den HH-Stellen. Es war gezeigt worden, dass Bacteroides forsythus in Kultur hohe Konzentrationen von MG ansammelt (unveröffentlichte Daten) und übereinstimmend damit wurden an den untersuchten DD-Stellen höhere Zahlen von B. forsythus gefunden als an den entsprechenden gesunden Stellen (2,7±4,2×105 versus 0,7±1,1×105; p=0,022). Die Zahl aller Keime des "Roten Komplexes" waren an DD-Stellen signifikant erhöht. Schlussfolgerungen: In Anbetracht der bekannten Proteine und DNS verändernden Effekte von MG unterstützt dieser Nachweis erhöhter MG-Spiegel in der SF bei Patienten mit chronischer Parodontitis die Hypothese, dass MG zur Gewebezerstörung bei Parodontitis beiträgt. Résumé Références et buts: Le méthylglyoxal (MG), un produit toxique du métabolisme cellulaire est retrouvé en quantitéélevée dans les tissus et les fluides lors de nombreuses maladies humaines. Une étude croisée fut réalisée pour déterminer si MG s'accumulait dans le fluide gingival (GCF) des patients atteints de parodontite chronique. Méthodes: Des échantillons de GCF furent prélevés pendant 30 secondes chacun de 3 dents avec des profondeurs de poches de plus de 3 mm (sites DD), chez 14 patients atteints de parodontites chroniques. Des échantillons contrôles furent prélevés sur des sites sains (sites DH) chez les mêmes patients, et aussi chez 7 sujets au parodonte sain (sites HH). Les volumes de fluide furent déterminés et les bandelettes ont été mises dans 0.5 N d'acide perchlorique. Puis, les échantillons furent transformés à l'aide de o-phenylenediamine et la méthylquinoxaline ainsi créée fut analysé par chromatographie liquide à haute performance sur une Lichrospher®-100 RP-18, avec détection aux UV. Résultats: Les profondeurs de poche moyenne étaient de 5.7 ± 0.7, 2.7 ± 0.6 et 2.7±0.5 mm (moyenne ± SD) pour les sites DD, DH et HH, respectivement. Les niveaux moyen de MG étaient de 208.7±241.7 et 142.9±235.7 pmol/site dans le fluide des sites in DD et DH, respectivement (p=0.0023), mais seulement de 11.5±4.4 pmol/site pour les sites HH. On a trouvé que Bacteroides forsythus accumulait de hauts niveaux de MG en culture (données non publiées) et les sites malades échantillonnés contenait effectivement de plus hauts niveaux de B. forsythus que les sites sains correspondants (2.7±4.2×105 contre 0.7±1.1×105, respectivement; p=0.022). Les microorganismes du complexe rouge étaient significativement en nombre élevé dans les sites DD. Conclusions: Au vu des effets connus de MG pour modifier les protéines et l'AND, la découverte de niveaux élevés de MG dans le fluide gingival de patients atteints de maladie parodontale chronique supporte l'hypothèse selon laquelle MG pourrait contribuer aux dommages tissulaires destructifs rencontrés au cours de cette maladie. [source]

    HHV-6, HHV-7, HHV-8 in gingival biopsies from chronic adult periodontitis patients

    JOURNAL OF CLINICAL PERIODONTOLOGY, Issue 3 2003
    A case, control study
    Abstract Background: Recent reports have suggested that various herpesviruses may be involved in the occurrence and progression of different forms of periodontal disease. Objective: The objective of the present study was to investigate the presence of the novel herpesviruses HHV-6, HHV-7 and HHV-8 in gingival biopsies from patients affected by chronic adult periodontitis. As control, gingival biopsies from periodontally healthy subjects were analysed. Materials and methods: Gingival biopsies were harvested from 23 volunteers: 13 patients affected by chronic adult periodontitis (CAP) and 10 periodontally healthy subjects. Each CAP patient contributed two biopsies involving the epithelium and connective tissue facing the sulcus/periodontal pockets: one biopsy from a site having a probing pocket depth (PPD) 5 mm and presenting with bleeding upon probing (affected site) at the time of biopsy collection, and the other biopsy from a site with PPD3 mm and without bleeding on probing (nonaffected site). After DNA extraction, nested PCR was used in herpesvirus identification. Results: HHV-6 DNA sequences were detected in one non-affected site (8%) and no affected sites (0%) of CAP patients. One biopsy (10%) in healthy subjects revealed HHV-6 positivity. Tissue specimens in 10/13 CAP patients (77%) and 7/10 healthy subjects (70%) contained HHV-7 DNA. HHV-7 prevalence in affected and nonaffected sites of CAP patients was 77% and 54%, respectively. HHV-8 was detected in 7.7% of CAP patients and 0% of healthy subjects. Conclusions: Gingival tissue may act as a reservoir for HHV-7. A high prevalence of HHV-7 was detected in both periodontally diseased and healthy individuals. The prevalence of HHV-6 and -8 was similarly low in both groups. Our data do not support an association of investigated herpesvirus species with destructive periodontal disease. Zusammenfassung Hintergrund: Kürzliche Studien haben angedeutet, dass verschiedene Herpesviren bei der Entstehung und Progression verschiedener Formen der parodontalen Erkrankungen involviert sein könnten. Ziel: Das Ziel der vorliegenden Studie war die Untersuchung einer Präsenz von neuen Herpesviren HHV-6, HHV-7 und HHV-8 in gingivalen Biopsien von Patienten mit chronischer Erwachsenen-Parodontitis. Als Kontrollen dienten gingivale Biopsien von parodontal gesunden Personen. Material und Methoden: Gingivale Biopsien wurden von 23 Freiwilligen, 13 Patienten mit chronischer Erwachsenen-Parodontitis (CAP) und 10 parodontal gesunden Personen gesammelt. Von jedem CAP Patient wurden zwei Biopsien mit Epithel und Bindegewebe von der parodontalen Tasche genommen: eine Biopsie von einer Fläche mit einer Sondierungstiefe (PPD) , 5 mm und positiver Provokationsblutung (geschädigte Fläche) zur Zeit der Biopsieentnahme, die andere Biopsie von einer Fläche mit einer PPD , 3 mm und ohne Provokationsblutung (nicht geschädigte Fläche). Nach der DNA-Extraktion wurde die PCR zur Virusidentifikation benutzt. Ergebnisse: HHV-6 DNA-Sequenzen wurden in einer nicht geschädigten Fläche gefunden (8 %) und bei keiner geschädigten Fläche (0 %) von CAP-Patienten. Eine Biopsie (10 %) bei gesunden Personen war HHV-6 positiv. Gewebeproben von 10/13 CAP Patienten (77 %) und von 7/10 gesunden Personen (70 %) enthielten HHV-7 DNA. Die HHV-7 Prävalenz in geschädigten und nicht geschädigten Flächen von CAP Patienten war 77 % und 54 %. HHV-8 wurde in 7,7 % der CAP Patienten und bei 0 % der gesunden Personen gefunden. Zusammenfassung: Gingivales Gewebe kann als Reservoir für HHV-7 dienen. Eine hohe Prävalenz von HHV-7 wurde sowohl bei parodontal erkrankten als auch bei gesunden Personen gefunden. Das Vorkommen von HHV-6 und HHV-8 war in beiden Gruppen ähnlich. Unsere Daten unterstützen eine Beziehung der untersuchten Herpesviren mit destruierenden parodontalen Erkrankungen nicht. Résumé Des rapports récents ont suggéré que différents virus de l'herpès pouvaient être associés à l'apparition et la progression de différentes formes de la maladie parodontale. Le but de l'étude présente a été d'analyser la présence des virus herpétiques HHV-6, HHV-7 et HHV-8 dans des biopsies gingivales provenant de patients atteints de parodontite chronique de l'adulte. Comme contrôle, des biopsies gingivales de patients sains du point de vue parodontal ont été analysées. Des biopsies gingivales ont été prélevées de 23 volontaires, 13 souffrant de parodontite chronique (CAP) et 10 sains. Chaque patient CAP procuraient deux biopsies comprenant l'épithélium et le tissu conjonctif en face des poches parodontales/sillons : une biopsie provenant d'un site avec une profondeur de poche au sondage (PPD) 5mm et présentant un saignement au sondage (site touché) au moment du prélèvement de la biopsie, l'autre biopsie provenait d'un site avec PPD 3 mm sans saignement au sondage (site sain). Après extraction de l'ADN le PCR a été utilisé pour l'identification des virus herpétiques. Des séquences ADN HHV-6 ont été détectées dans un site sain (8%) mais dans aucun site touché (0%) chez les patients CAP. Une biopsie (10%) chez les sujets sains était HHV-6 positive. Les spécimens tissulaires de dix des treize patients CAP (77%) et sept des dix patients sains (70%) avaient de l'ADNHHV-7. La fréquence globale de HHV-7 dans les sites sains et touchés des patients CAP étaient respectivement de 77 et 54 %. HHV-8 était détecté chez 7,7 % des patients CAP et 0% des patients sains. Le tissu gingival peut servir de réservoir au HHV-7. Une importante fréquence globale de HHV-7 était détectée tant chez les individus sains que chez ceux avec parodontite. La fréquence globale de HHV-6 et HHV-8 était pareillement faible dans les deux groupes. Ces données ne défendent pas la thèse d'une association des virus herpétiques étudiés à la maladie parodontale destructrice. [source]

    Root defects following air polishing

    JOURNAL OF CLINICAL PERIODONTOLOGY, Issue 2 2003
    An in vitro study on the effects of working parameters
    Abstract Aim: Air-polishing devices (APDs) are highly effective in removing plaque and extrinsic staining. Their application on root surfaces, however, may result in clinically relevant substance removal, limiting the use in patients with periodontitis, where denuded root surfaces are frequently found. Therefore, the purpose of the study was to assess the influence of different working parameters on root damage and to identify those minimizing root damage. Material and methods: Defect depth and defect volume after instrumentation of roots with an APD (Dentsply Prophy-Jet®) using conventional NaHCO3 powder at instrumentation times of 5, 10 and 20 s, combinations of low, medium and high powder and water settings, distances of 2, 4 and 6 mm, and angulations of 45° and 90° were quantified laseroptically. A total of 297 roots were instrumented and parameter combinations were performed in triplicate. The influence of each working parameter on substance loss was determined by multiple regression analysis. Results: Time had the greatest influence on defect volume and depth (,-weights 0.6 and 0.57, respectively), when compared with powder setting (,-weights 0.49 and 0.3) and water setting (,-weights 0.28 and 0.3). Variations in distance affected defect depth (,-weight 0.44), but not volume (,-weight 0.04). No major differences were found at 45° and 90°. Various parameter combinations led to maximal defect depths of 473.5 ± 26.2 µm within 20 s. Conclusion: Root damage varies among combinations of working parameters. Using the APD with the assessed NaHCO3 powder, all parameter combinations led to substantial root damage. Thus, APDs using NaHCO3 may not be safely utilized on exposed root surfaces. Zusammenfassung Wurzeldefekte nach Pulverstrahlpolitur , Eine In-vitro-Untersuchung zur Auswirkung der Arbeitsparameter Hintergrund: Pulverstrahlgeräte sind sehr wirksam in der Entfernung von Plaque und externen Zahnverfärbungen. Die Bearbeitung von Wurzeloberflächen kann aber zu klinisch relevanten Hartsubstanzabträgen führen, die den Einsatz bei Parodontitispatienten einschränken, bei denen häufig entblößte Wurzeloberflächen gefunden werden. Zielsetzung: Untersuchung des Einflusses verschiedener Arbeitsparameter auf die Wurzeloberflächenschädigung mit dem Ziel diese zu reduzieren. Material und Methoden: Defekttiefe und ,volumen wurden nach Instrumentierung der Wurzeloberflächen mit einem Pulverstahlgerät (Dentsply Prophy-Jet®) bei Verwendung von konventionellem NaHCO3 -Pulver bei Bearbeitungszeiten von 5, 10 and 20 Sekunden, Kombinationen von niedrigen, mittleren und hohen Pulver- und Wassereinstellungen, Abständen von 2, 4 und 6 mm sowie Arbeitswinkeln von 45° und 90° laseroptisch quantifiziert. Insgesamt 297 Wurzeln extrahierter Zähne wurden bearbeitet und die Parameterkombinationen dreimal wiederholt. Der Einfluss der Arbeitsparameter auf den Substanzabtrag wurde für jeden Parameter mittels multipler Regressionsanalyse bestimmt. Ergebnisse: Zeit hatte den größten Einfluss auf Defektvolumen und -tiefe (ß-Gewichte 0,6 und 0,57) im Vergleich zur Pulver- (,-Gewichte 0,49 und 0,3) und Wassereinstellung (,-Gewichte 0,28 und 0,3). Veränderungen des Arbeitsabstandes beeinflussten die Defekttiefe (,-Gewicht 0,44), aber nicht das Volumen (,-Gewicht 0,04). Keine wesentlichen Unterschiede wurden zwischen den Arbeitswinkeln 45° und 90° gefunden. Die verschiedenen Parameterkombinationen führten zu maximalen Defekttiefen von 473,5±26,2 ,m innerhalb von 20 s. Schlussfolgerung: Der Substanzabtrag von Wurzeloberflächen unterscheidet sich für die verschiedenen Kombinationen der Arbeitsparameter. Bei Verwendung von Pulverstrahlgeräten mit dem untersuchten NaHCO3 -Pulver führten alle Kombinationen der Arbeitsparameter zu wesentlichen Substanzverlusten. Deshalb können Pulverstrahlgeräte mit NaHCO3 nicht sicher zur Reinigung freiliegender Wurzeloberflächen verwendet werden. Résumé Lésions radiculaires après aéro-polissage- une étude in vitro sur les effets des paramètres de travail. But de l'étude: Les aéro-polisseurs (APDs) sont très efficace pour l'élimination de la plaque et des colorations extrinsèques. Leur application sur les surfaces radiculaires, cependant, peut résulter en l'élimination cliniquement significative de substance ce qui limite leur utilisation chez les patients souffrant de parodontite, chez lesquels on observe fréquemment des dénudations radiculaires C'est pourquoi cette étude se propose de mettre en évidence l'influence des divers paramètres de travail sur les dommages radiculaires et d'identifier ceux qui limiteraient ces dommages. Matériels et Méthodes: La profondeur des lésions et le volume après instrumentation des racines avec un APD (Dentsply Prophy-Jet®) utilisant une poudre classique de NaHCO3 sur des durées d'utilisation de 5, 10 et 20 secondes, avec des combinaisons de réglages d'eau et de poudre bas, moyen et fort, à des distances de 2, 4 et 6 mm, et avec des angulations de 45° et 90° furent quantifiées par laser-optique. 297 racines furent instrumentées et les combinaisons de paramètres furent appliquées trois fois. L'influence de chaque paramètre de travail sur la perte de substance fut déterminée par analyse de régression multiple. Resultats: La durée avait la plus grande influence sur le volume des lésions et sur leurs profondeurs (,-poids 0.6 et 0.57 respectivement), lorsqu'on la comparait avec les réglages de poudre (,-poids 0.49 et 0.3) et d'eau (,-poids 0.28 et 0.3). Les variations de distance affectait les profondeurs des lésions (,-poids 0.44), mais pas le volume (,-poids 0.04). Aucune différence majeure ne put être trouvée entre les angulations. Les diverses combinaisons de paramètre entraînaient des profondeur de défaut maximales de 473.5±26.2 ,m en 20 s. Conclusion: les dommages radiculaires varient selon les combinaisons de paramétres de travail. Lors de l'utilisation de l'APD avec sa poudre de NaHCO3, toutes les combinaisons entraînaient des dommages radiculaires substantiels. Ainsi, les APDs à NaHCO3 ne peuvent pas être utilises en toute sécurité sur les surfaces radiculaires exposées. [source]

    Effect of an amine-fluoride-triclosan mouthrinse on plaque regrowth and biofilm vitality

    JOURNAL OF CLINICAL PERIODONTOLOGY, Issue 4 2002
    Nicole B. Arweiler
    Abstract Background: The purpose of this double-blind, prospective, latin-square crossover randomised study was to examine the efficacy of a mouthrinse solution containing a combination of triclosan, amine fluoride and sodium fluoride on supragingival plaque regrowth compared to a placebo and a chlorhexidine solution. Methods: 12 volunteers refrained after professional oral prophylaxis from all mechanical hygiene measures for the following 96 h and rinsed instead cross-over in a randomised order with either chlorhexidine dicluconate (0.2%, positive control), a verum solution (0.5% amine fluoride, 0.028% sodium fluoride, 0.03% triclosan) or a placebo solution. The plaque index was assessed after 24 and 96 h (PI 1, PI 2) and the plaque area (PA) photographed and calculated after 96 h of undisturbed plaque regrowth. Moreover plaque samples were taken after 24 and 96 h and examined with the vital fluorescence technique to assess the vitality of the biofilm microbiota (VF 1, VF 2). Results: The amine-fluoride-triclosan solution reduced the clinical parameters (PI and PA) as well as the vitality of the plaque flora (VF) significantly when compared to the placebo solution. The verum reached a 36.5% (p<0.05) and a 39.8% reduction (p<0.0001) in PI 1 and PI 2, respectively, concomittant with a reduction of 23.8% and 32.2% (p<0.001) in VF 1 and VF 2 and of 46.9% (p<0.0001) in PA at day 4. This was less than the reductions found with the positive control, i.e., the 0.2% chlorhexidine solution (54.2% and 71.1% reduction in PI 1 and PI 2, 40.0% and 53.4% in VF 1 and VF 2 and 71.5% in PA). However, significant differences between both active solutions were only established for PI 2 and PA. Conclusion: During 4-day plaque regrowth the amine-fluoride-triclosan product displayed a significant antibacterial and plaque-reducing action in comparison to the control. Zusammenfassung Hintergrund: Der Zweck dieser prospektiven, gekreuzten, randomisierten Doppeltblindstudie war die Überprüfung der Effektivität einer Mundspüllösung, die eine Kombination von Triclosan, Aminfluorid und Natriumfluorid enthielt, auf die Neuetablierung der supragingivalen Plaque im Vergleich zu einem Placebo und einer Chlorhexidinlösung. Methoden: 12 Probanden wurde nach einer professionellen Prophylaxe jegliche mechanische Hygiene für die folgenden 96 Stunden untersagt. Sie spülten dafür überkreuzt in einer zufälligen Reihenfolge entweder mit Chlorhexidindiglukonat (0.2%, positive Kontrolle), einer Versuchslösung (0.5% Aminfluorid, 0.028% Natriumfluorid, 0.03% Triclosan) oder einer Placebolösung. Der Plaque-index wurde nach 24 Stunden und 96 Stunden erhoben (PI 1, PI 2). Die Plaquefläche (PA) wurde fotografiert und berechnet nach 96 Stunden des ungestörten Plaquewachstums. Zusätzlich wurden Plaqueproben nach 24 und 96 Stunden entnommen und mit der Vitalfluoreszenztechnik die Vitalität der Mikroflora des Biofilms bestimmt (VF 1, VF 2). Ergebnisse: Die Aminfluorid-Triclosan-Lösung reduzierte die klinischen Parameter (PI und PA) sowie die Vitalität der Plaqueflora (VF) signifikant, im Vergleich mit der Placebolösung. Die Versuchslösung erreichte eine 36.5%ige (p<0.05) und eine 39.8%ige Reduktion (p<0.001) bei PI 1 und PI 2, verbunden mit einer Reduktion von 23.8% und 32.2% (p<0.01) bei VF 1 und VF 2 und 46.9% (p<0.0001) bei PA am Tag 4. Dies war geringer als die Reduktionen, die mit der positiven Kontrolle gefunden wurden, d.h. mit der 0.2%igen Chlorhexidin-Lösung (54.2% und 71.1% Reduktion bei PI 1 und PI 2, 40.0% und 53.4% bei VF 1 und VF 2 sowie 71.5% bei PA). Jedoch wurden signifikante Differenzen zwischen beiden aktiven Lösungen nur bei PI 2 und PA gefunden. Zusammenfassung: Während eines 4tägigen Plaquewachstums zeigte das Aminfluorid-Triclosan-Produkt eine signifikante antibakterielle und plaquereduzierende Wirkung im Vergleich zu der Kontrolle. Résumé Origine: Le but de cette étude randomisée, croisée, prospective en double aveugle a été d'examiner l'efficacité d'une solution contenant une association de fluorure d'amine, de fluorure de sodium et de triclosan sur l'accumulation de la plaque dentaire sus-gingivale comparée à un placebo et à une solution de chlorhexidine (CHX). Méthodes: Après un nettoyage professionnel, 12 volontaires ont arrêté toutes mesures d'hygiène buccale pendant 96 h. Ils se sont rinçés de manière randomisée et croisée avec du digluconate de CHX 0.2%, une solution verum (fluorure d'amine 0.5%, fluorure de sodium 0.028% et triclosan 0.03%) ou une solution placebo. L'indice de plaque a été mesurée après 24 h (Pli 1) et 96 h (Pli 2) et la zone de plaque (PA) photographiée et calculée après 96 h. Des échantillons de plaque dentaire ont été prélevés après 24 h (VF 1) et 96 h (VF 2) et examinés par la technique de vitalité de fluorescence, pour mesurer la vitalité de la flore du biofilm. Résultats: La solution flurorure d'amine/triclosan réduisait significativement les paramètres cliniques (Pli et PA) ainsi que la vitalité de la flore (VF) comparée à la solution placebo. Le vérum atteignait des réductions respectives de 37% (p<0.05) et 40% (p<0.0001) des Pli 1 et Pli 2 concomitantes avec une réduction de 24 et 32% (p<0.001) de VF 1 et VF 2 et de 47% (p<0.0001) de PA au jour 4. Ceci était inférieur aux réductions trouvées dans le contrôle positif, c.-à-d. la CHX 0.2% (54 et 71% de réduction de Pli 1 et Pli 2, 40 et 53% de VF 1 et VF 2, et 72% de PA). Cependant, les différences significatives entre les deux solutions actives ont été mises en évidence uniquement pour Pli2 et PA. Conclusion: Durant cette courte croissance de la plaque dentaire, le produit fluorure d'amine/triclosan montrait une action antibactérienne et anti-plaque supérieure à celle du contrôle. [source]