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Plantation Design (plantation + design)

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Life Sciences	100%

Selected Abstracts

Effect of plantation design on stem-infecting form of rust in willow biomass coppice

FOREST PATHOLOGY, Issue 2 2002
T. HUNTER
Planting of genotype mixtures is a major strategy for the non-chemical control of willow rust in short-rotation coppice willows grown for biomass. In 1997 and 1998, the relative severity and spatiotemporal distribution of stem canker damage by Melampsora spp. on Salix viminalis `Bowles Hybrid' in a field trial containing monocultures and two design mixtures (random or regular) of three or five genotypes were assessed. Sphaerellopsis filum, a hyperparasite of Melampsora spp. was detected in all plots during the summer (1998) between the time of the two canker assessments. The percentage of rust pustules with this hyperparasite was initially greater in monoculture plantings than in mixtures in June, but by July, more than 92% of pustules were parasitized, irrespective of plantation design. The stem rust assessments showed that, in general, there were fewer cankers per stool in plots containing mixtures of willow genotypes compared with monoculture plantings. The distribution of rust cankers was different between monocultures and willow mixture designs, with differences between years for monocultures. Effet du type de plantation sur l'infection de la tige par la rouille, dans un taillis de saule Le mélange de clones constitue une stratégie majeure pour controler non chimiquement la rouille du saule dans les taillis à courte rotation en vue de la production de biomasse. En 1997 et 1998, on a évalué la gravité et la répartition spatio-temporelle du chancre de tige provoqué par Melampsora spp. sur Salix viminalis `Bowles Hybrid' dans un essai au champ comprenant des parcelles monoclonales ou deux types de mélange de 3 ou 5 clones (régulier ou aléatoire). Sphaerellopsis filum, un hyperparasite de Melampsora spp. a été détecté dans toutes les parcelles pendant l'été (1998) entre les deux dates d'évaluation du chancre. En juin, le pourcentage initial de pustules de rouille infectées par l'hyperparasite était plus élevé dans les parcelles monoclonales que dans les mélanges; en juillet, plus de 92% des pustules étaient parasitées, quel que soit le type de parcelles. L'évaluation de la rouille de tige a montré qu'en général il y avait moins de chancres par pied-mère dans les parcelles polyclonales que dans les parcelles monoclonales. La répartition des chancres de rouille était différente entre les parcelles mono et polyclonales; des différences existaient aussi entre les années dans les parcelles monoclonales. Der Einfluss des Pflanzschemas auf die Infektion mit Stammrost in Weidenplantagen Sortenmischung ist eine der besten Strategien zur biologischen Bekämpfung des Weidenrosts in Weiden-Energieholz-Plantagen mit kurzer Umtriebszeit. Mischkulturen mit drei oder fünf Genotypen, die nach einem zufälligen oder regelmässigen Muster angelegt wurden, sowie Monokulturen von Salix viminalis `Bowles Hybrid' wurden 1997 and 1998 auf das relative Schadensausmass und die räumlich-zeitliche Verteilung durch von Melampsora spp. verursachten Krebsen in Feldversuchen verglichen. Sphaerellopsis filum, ein Hyperparasit von Melampsora spp., wurde im Sommer 1998 in der Periode zwischen den beiden Erhebungsterminen in allen Versuchsflächen nachgewiesen. Im Juni war der Prozentsatz von Rostpusteln mit Hyperparasitenbefall in den Monokulturen höher als in den Flächen mit mehreren Genotypen, aber ab Juli waren unabhängig von der Kulturform > 92% der Pusteln parasitiert. Die Erhebungen zeigten, dass in Mischkulturen im Vergleich zu den Monokulturen im allgemeinen weniger Krebse pro Stock beobachtet wurden. Die Verteilung der Krebse in Mono- und Mischkulturen waren verschieden. Zudem wurden für die Monokulturen Unterschiede zwischen den beiden Jahren festgestellt. [source]

sofsog: a suite of programs to avoid inbreeding in plantation designs

MOLECULAR ECOLOGY RESOURCES, Issue 2 2010
J. FERNÁNDEZ
Abstract Cost-effective ways of controlling inbreeding in conservation or productive plantations imply the allocation of individuals reducing the possibility of close relatives' mating and, consequently, limiting inbreeding. sofsog is a suite of programs, which helps to design plantation sites. First, if the plantation scheme involves several plots, it allows distribution of individuals available among different sites minimizing within-site global coancestry. Then, it yields a plantation design for each site, either following the classical permutated neighbourhood strategy or the recently developed method by Fernández and González-Martínez. This new method allows the implementation of different pollen dispersion kernels, and to include in the designing strategy any available information on individual relationships, reproductive success, differences in phenology, etc., via weighting or penalization matrices. Additionally, the package includes a tool for calculating the molecular coancestry (Identity By State) from codominant marker data. [source]