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Et III (et + iii)

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Selected Abstracts

Genetic diversity of the hyperparasite Sphaerellopsis filum on Melampsora willow rusts

FOREST PATHOLOGY, Issue 5 2004
M. Liesebach
Summary The non-specific rust hyperparasite Sphaerellopsis filum occurs naturally on Melampsora rusts of many species of the genus Salix as well as on a large range of other rust genera worldwide. To study the genetic diversity of the hyperparasitic fungus 77 S. filum isolates collected from rusts on willow clones from plantations, clone collections and natural habitats of different sites were investigated using polymerase chain reaction - restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP) analysis of the rDNA internal transcribed spacer regions including 5.8S rDNA and sequence analysis. Additionally, strains from Melampsora poplar rusts (4) and strains of Puccinia abrupta from Parthenium hysterophorus (5) and of P. obscura from Bellis perennis (1) were used for comparisons. Results of genetic analysis demonstrated distinct variation within the S. filum isolates. Two main groups with more than 32% difference between their nucleotide sequences were distinguished, indicating two taxa within S. filum. Within the first main group three profiles (I, II, III) were detected. The differences between these profiles were about 12%. The variation within each profile was very low (less than 2%). The second main group comprised two profiles (IV, V), which differed in 12 to 16% of their nucleotide positions. The isolates of group IV possessed a higher variation (up to 5%) within the group than those of the first main group (I, II, III). Group V was only represented by a single isolate. Neither interrelations between the S. filum profiles and the Melampsora genotypes nor a spatial distribution could be detected. It is remarkable that the six strains of S. filum from Puccinia rusts belong to one subgroup. Résumé Sphaerellopsis filum est un hyperparasite non spécifique des rouilles qui se rencontre naturellement sur les Melampsora affectant le genre Salix ainsi que sur une large gamme d'autres genres de rouille dans le monde entier. Pour caractériser la diversité de ce champignon hyperparasite, 77 isolats de S. filum, récoltés à partir de lésions de rouille sur des clones de plantation, des collections de clones et dans des sites naturels, ont étéétudiés par analyse PCR-RFLP des régions ITS de l'ADNr, incluant le 5.8S rDNA, et par analyse de séquences. Des souches provenant de Melampsora des peupliers (4), de Puccinia abrupta sur Parthenium hysterophorus (5) et de P. obscura sur Bellis perennis (1) ont également été utilisées pour comparaison. L'analyse génétique démontre une variation entre isolats de S. filum. Deux groupes principaux, avec plus de 32% de différence dans leur séquence nucléotidique, se distinguent, indiquant l'existence de deux taxons au sein de S. filum. A l'intérieur du premier groupe, trois profils (I, II, III) sont mis en évidence, avec une différence d'environ 12% entre profils mais très peu de variation (moins de 2%) à l'intérieur d'un profil. Le deuxième groupe comprend deux profils (IV, V) qui différent de 12 à 16% pour leur séquence nucléotidique. Les isolats du groupe IV présentent une variation intra-groupe plus importante (jusqu'à 5%) que ceux des groupes I, II et III. Le groupe V n'est représenté que par un isolat. Aucune relation n'a pu être établié entre les profils de S. filum et les génotypes de Melampsora ou la distribution spatiale. Il est à noter que les six isolats de S. filum provenant de rouilles àPuccinia appartiennent à un seul sous-groupe. Zusammenfassung Der Hyperparasit Sphaerellopsis filum kommt natürlich auf Melampsora -Rostpilzen bei Salicaceae und auf zahlreichen anderen Rostgattungen weltweit vor. Um die genetische Vielfalt dieses hyperparasitischen Pilzes zu untersuchen, wurden 77 S. filum -Proben, die von Weidenrosten in Plantagen, Klonsammlungen und von verschiedenen natürlichen Standorten stammen, isoliert. Die 5.8S-ITS-Abschnitte der rDNA wurden mit Hilfe der PCR-RFLP untersucht und Sequenzen analysiert. Zum Vergleich wurden vier Isolate von Pappelrosten sowie fünf Isolate von Puccinia abrupta von Parthenium hysterophorus und ein Isolat von Puccinia obscura von Bellis perennis herangezogen. Die Ergebnisse der genetischen Untersuchungen zeigten eine deutliche Variation zwischen den S. filum -Isolaten. Zwei Gruppen mit über 32% Unterschied in der Nukleotid-Sequenz ließen sich unterscheiden. Dies deutet auf zwei taxonomische Einheiten von Sphaerellopsis hin. Die erste Gruppe ließ sich in drei Untergruppen (I, II, III) einteilen, deren 5.8S-ITS-Profile im Mittel 12% Unterschied aufwiesen. Die Variation innerhalb dieser drei Profile war sehr gering (,2%). Die zweite Gruppe umfasste zwei Profile (IV, V), die sich an 12 bis 16% Positionen ihrer Nukleotid-Abfolge unterschieden. Die Variation innerhalb von Profil IV war höher (bis 5%) als die der Untergruppen I - III, Profil V war nur durch ein Isolat vertreten. Eine Beziehung des S. filum -Genotyps zum Melampsora -Genotyp der Weide oder der Pappel ließ sich bei dem untersuchten Material nicht nachweisen, ebenso konnte keine geographische Differenzierung gefunden werden. Auffällig ist, dass alle sechs Puccinia -Isolate einer Untergruppe angehörten. [source]

The role of controlled drainage under drought conditions in an irrigated area in NWFP, Pakistan,

IRRIGATION AND DRAINAGE, Issue 2 2003
Gul Daraz Khan
sécheresse; drainage commandé; eaux souterraines; efficacité d'utilisation de l'eau et rendement Abstract The River Swat is the source of irrigation for the entire irrigation system of Mardan, Nowshera and Charsadda districts. Reductions of water and overdrainage have influenced the yield of major crops. The impact of reduced supply at the inlet from the source, drought conditions and overdrainage from the area have lowered the groundwater to a disastrous level. Thus the present groundwater level cannot contribute to the crops. A subsurface collector at its exit in drainage unit 106 was controlled to raise the watertable. The study area was divided into 10 zones. Each zone was separately assessed to analyze the groundwater impact in response to the controlled technique adopted for mitigating drought in different strategies of the canal operation. The interaction of groundwater level with irrigation depth, crop yield, water use efficiency and water saving were also studied. During the rotational period of the canal, irrigations applied in section II raised the water level by nearly 1 m. The upslope area of section III also needed a large irrigation depth. The groundwater level on the downslopes of the lateral drains in sections I and V was at the design depth of 1.1 m during the rotational strategy, while it decreased only slightly on the upslopes of the lateral drains for the same positions. Because of effective control by the collector, the watertable on the downslopes of the laterals in sections II and III was affected less while in the respective upslope area of section III it dropped more than 2 m. The water levels in section IV (both in the upslope and downslope areas along the laterals) remained very close to the design level. A significant contribution of seepage in the upslope of the collector drain considerably reduced the irrigation depths. During the canal closure period, the watertables in the study area dropped to the limit from 2.3 to 3.25 m. After the reopening of the canal, the watertables in sections II, III and IV were raised from 2.55 to 0.70 m. During this period the water levels near the canal reached the design level. The maximum yield of 6.5 tons ha,1 on the downslopes of the lateral drains in section II was obtained, resulting in maximum water use efficiency of 0.93 kg m,3. However, the minimum yield of 3.5 tons ha,1 on the upslopes of the lateral drains in section I was obtained, resulting in the lowest water use efficiency of 0.35 kg m,3 near the deep surface drain (5 m). The impact of controlled subsurface drainage in zones 2, 3 and 7 resulted in the best maintenance of optimum groundwater level and moisture content. Therefore large amounts of extra irrigation water applied (ranging from 23 to 129% of that actually required) in different zones of the controlled area can be saved for drought conditions. Copyright © 2003 John Wiley & Sons, Ltd. RÉSUMÉ Le fleuve Swat est la source d'irrigation pour les systèmes d'irrigation entiers des zones de Mardan, de Nowshera et de Charsadda. Les réductions de drainage de l'eau et d'excédent ont influencé le rendement de récoltes principales. L'impact de l'approvisionnement réduit à l'admission de la source, des conditions de sécheresse et du drainage d'excédent du secteur ont laissé tomber les eaux souterraines à un niveau désastreux. Ainsi le niveau actuel d'eaux souterraines ne peut pas contribuer aux récoltes. Un collecteur à fleur de terre à sa sortie dans l'unité 106 de drainage a été commandé pour soulever le niveau hydrostatique. Le secteur d'étude a été divisé en dix zones. Chaque zone a été séparément évaluée pour analyser l'impact d'eaux souterraines en réponse à la technique commandée adoptée pour atténuer la sécheresse dans différentes stratégies de l'opération de canal. L'interaction du niveau d'eaux souterraines sur la profondeur d'irrigation, le rendement de récolte, l'efficacité d'utilisation de l'eau et l'économie de l'eau ont été également étudié. Pendant la période de rotation du canal, les irrigations appliquées dans la section II ont élevé le niveau d'eau de presque un mètre. Le secteur demontée de la section III avait besoin d'une grande profondeur d'irrigation. Le niveau d'eaux souterraines des déscentes de la vidange latérale dans les sections I et V était à la profondeur de conception de 1.1 m pendant la stratégie de rotation, tandis qu'il diminuait seulement légèrement aux montée des drains latéraux pour les mêmes positions. En raison de la commande efficace du collecteur, le niveau hydrostatique des déscentes des parties latérales dans les sections II et III a été affecté moins, tandis que dans le secteur respectif demontée de la section III il descentait à plus de deux mètres. Les niveaux d'eau dans la section IV (tous les deux dans les secteurs demontée etde déscentes le long des parties latérales) ont demeuré très près de la conception. La contribution significative de l'infiltration dans lamontee du drain de collecteur a considérablement réduit les profondeurs d'irrigation. Pendant la période de fermeture du canal, les niveaux hydrostatiques dans le secteur d'étude sont descendus la limite de 2.3 à 3.25 m. A la réouverture du canal, les niveaux hydrostatiques dans les sections II, III et IV augmenté de 2.55 à 0.70 m. Pendant cette période les niveaux d'eau près du canal ont atteint celui de la concept. Le rendement maximum de 6.5 tons ha,1 aux déscentes des drains latéraux dans la section II a été obtenu, ayant pour résultat l'efficacité maximum d'utilisation de l'eau de 0.93 kg m,3.Cependant le rendement minimum de 3.5 tons ha,1 aux montées des drains latéraux dans la section a été obtenu, ayant pour résultat la plus basse efficacité d'utilisation de l'eau de 0.35 kg m,3 près du drain extérieur profond (5 m). L'impact du drainage à fleur de terre commandé dans les zones 2, 3 et 7 a maintenu le meillear niveau d'eaux souterraines et le contenu d'humidité optimum. Par conséquent la grande quantité de l'eau supplémentaire d'irrigation celle appliquée (s'étendant de 23 à 129% deréellement requise) dans différentes zones de la zone de contrôle peut être sauvée pour les conditions de sécheresse. Copyright © 2003 John Wiley & Sons, Ltd. [source]

Morphology, chemical structure and diffusion processes of root surface after Er:YAG and Nd:YAG laser irradiation

JOURNAL OF CLINICAL PERIODONTOLOGY, Issue 6 2001
B. Ga
Abstract Objectives: The aim of this in vitro study was to evaluate the effects of Er:YAG and Nd:YAG lasers on morphology, chemical structure and diffusion processes of the root surface. Material and methods: 60 root samples were irradiated for 1 min each either with 60 mJ/p, 80mJ/p and 100mJ/p using Er:YAG laser or with 0.5W, 1.0W and 1.5W using Nd:YAG laser. Scanning electron microscopy (SEM) was used to determine the morphology, infrared (IR) spectroscopy to assess the alterations in chemical structure and one dimensional electron paramagnetic resonance imaging (1-D EPRI) was used to estimate the diffusion coefficients in dental root samples. Results: Er:YAG laser treatment resulted in deep crater formation with exposed dentin. Morphological alterations of root surface after Nd:YAG laser irradiation included cracks, crater formation, meltdown of the root mineral and resolidified porous globules formation. Er:YAG laser failed to alter the intensity of Amide peaks I, II or III. In contrast, treatment with Nd:YAG laser, using the highest power setting of 1.5W, reduced the intensity of Amide peak II and III in comparison to the control. The diffusion coefficients were increased significantly in all Er:YAG and Nd:YAG treated root samples. Conclusion: This study demonstrated that Er:YAG laser influences only on morphology and diffusion processes of root surfaces, while Nd:YAG laser also alters the chemical structure of root proteins. Zusammenfassung Ziele: Das Ziel dieser in vitro Studie war es, die Wirkung von Er:YAG- und Nd:YAG-Laser auf die Morphologie, chemische Struktur und die Diffusionsprozesse zu evaluieren. Material und Methoden: 60 Proben von Wurzeln wurden für eine Minute entweder mit einem Er:YAG-Laser und 60 mJ/p, 80 mJ/p und 100 mJ/p oder einem Nd:YAGLaser und 0.5 W, 1.0 W und 1.5 W bestrahlt. Die Rasterelektronenmikroskopie (REM) wurde verwendet um die Morphologie zu bestimmen, Infrarotspektroskopie (IR) zur Messung der Veränderung in der chemischen Struktur und die eindimensionale paramagnetische Elektronenresonanz-Bildgebung (1-D EPRI) wurde verwendet um die Diffusions-Koeffizienten in den dentalen Wurzelproben abzuschätzen. Ergebnisse: Die Behandlung mit dem Er: YAG-Laser resultierte in der Ausbildung tiefer Krater mit exponiertem Dentin. Die morphologischen Veränderungen der Wurzeloberfläche nach Bestrahlung mit dem Nd: YAG-Laser waren Brüche, Kraterbildung, Aufschmelzen des Wurzelminerals und Bildung wiederverfestigter poröser Globuli. Mit dem Er:YAG-Laser gelang es nicht die Intensität der Amid-peaks I, II oder III zu verändern. Im Gegensatz dazu reduzierte die Behandlung mit dem Nd:YAG-Laser im Vergleich mit der Kontrolle bei der höchsten Leistungseinstellung von 1.5 W die Intensität der Amid-Peaks II und III. In allen mit Er: YAG und Nd:YAG behandelten Wurzelproben waren die Wurzeldiffusionskoeffizienten signifikant erhöht. Schlussfolgerung: Diese Studie demonstrierte, dass der Er:YAG-Laser nur die Morphologie und die Diffusionsprozesse der Wurzeloberfläche beeinflusst, während der Nd: YAG-Laser auch die chemische Struktur der Wurzelproteine verändert. Résumé Morphologie, structure chimique et processus de diffusion de surfaces radiculaires après irradiation au lasers Er:YAG et Nd:YAG But: Le but de cette étude in vitro était d'évaluer les effets des lasers Er:YAG et Nd:YAG sur la morphologie, la structure chimique et les processus de diffusion des surfaces radiculaires. Matériaux et méthodes: 60 échantillons de racines furent irradiés pendant 1 min chacun par 60 mJ/p, 80 mJ/p et 100 mJ/p avec le laser Er:YAG ou par 0.5 W, 1.0 W et 1.5 W avec le laser Nd:YAG. La microscopie électronique à balayage (SEM) a été utilisée pour déterminer la morphologie, la spectroscopie infra rouge pour mettre en évidence les altérations de la structure chimique et l'imagerie en une dimension par résonnance magnétique électronique (1-DEPRI) fut utilisée pour estimer les coefficients de diffusion dans les échantillons de racines dentaires. Résultats: Le traitement au laser Er:YAG entrainait la formation de cratères profonds avec de la detine exposée. Les altérations morphologiques de la surface radiculaire après irradiation au laser Nd:YAG prenaient la forme de félures, de cratères, fusion du minéral radiculaire et formation de globules poreux resolidifiés. Le laser Er:YAG n'arrivait pas à altérer l'intensité des pics Amide I, II our III. Au contraire, le traitement au laser Nd:YAG, en utilisant la plus haute puissance de 1.5 W, réduisait l'intensité des pics Amide II et III, par rapport au contrôle. Les coefficients de diffusion étaient significativement augmentés pour toutes les racines traitées par les lasers Er:YAG et Nd:YAG. Conclusions: Cette étude démontre que le laser Er:YAG a une influence sur seulement la morphologie et les processus de diffusion des surfaces radiculaires alors que le laser Nd:YAG modifie également la structure chinique des protéines radiculaires. [source]

Two new lipoaminoacids with complementary modes of action: new prospects to fight out against skin aging

INTERNATIONAL JOURNAL OF COSMETIC SCIENCE, Issue 1 2010
S. Dumont
Synopsis The mode of action of two cosmetic active ingredients (AIs), palmitoyl glycine (PG) and cocoyl alanine (CA) was studied with cDNA array experiments and quantitative PCR confirmations, which were performed on experimentally aged human fibroblasts. These preliminary studies revealed complementary profiles. Thus, specific supplementary investigations were then carried out for each AI. Protocols used were based either on in vitro models: (i) biochemical assays, (ii) monolayer cell culture (primary human fibroblasts and keratinocytes) and (iii) the model of capillary-like tube formation by human endothelial cells or on ex vivo models, i.e. topically treated skin explants and both immunohistochemical and ChromameterTM investigations. New prospects are proposed to fight out against skin aging. Indeed, PG and CA showed complementary properties and thus enabled a regulation or a restoration effect on main aging-associated disorders. Thus, they can not only act on tissue architecture, cell,cell interactions and extracellular matrix protection but also on inflammation, cell longevity, skin immune system protection, skin radiance and stem cell survey. Finally, a clinical trial performed on Caucasian women confirmed AI anti-wrinkle efficacy, which was superior to that of a market reference ingredient. In the future, complementary experiments enabling a better understanding of the aging-induced decline of epidermal stem cells would be of a great interest. Résumé Le mode d'action de deux actifs cosmétiques, Palmitoyl glycine (PG) et Cocoyl Alanine (CA), a été déterminéà l'aide d'expériences de cDNA arrays et de confirmations par qPCR, réalisées sur des fibroblastes humains vieillis expérimentalement. Ces études préliminaires ont révélé des modes d'action complémentaires. Des expériences supplémentaires spécifiques ont donc ensuite été réalisées pour chaque actif. Les protocoles utilisés étaient basés sur des modèles in vitro: i) études biochimiques, ii) cultures cellulaires en monocouches (cultures primaires de fibroblastes et de kératinocytes humains) et iii) modèle de formation de pseudo-tubules par des cellules endothéliales humaines; ou sur des modèles ex-vivo, i.e. des explants de peau traités de manière topique et analysés à l'aide d'études immuno-histochimiques et d'un ChromamètreTM. De nouvelles perspectives s'ouvrent pour combattre le vieillissement cutané. En effet, PG et CA montrent des propriétés complémentaires et permettent ainsi une régulation ou une restauration des principaux dysfonctionnements liés à l'âge. Ainsi, ils peuvent agir non-seulement sur l'architecture des tissus, l'interaction entre les cellules et la protection de la matrice extracellulaire mais aussi sur l'inflammation, la longévité cellulaire, la survie des cellules souches, le système de protection immunitaire et l'éclat de la peau. Finalement, des essais cliniques réalisés sur des femmes de type Caucasien ont confirmé l'efficacité antirides des actifs, laquelle était supérieure à celle d'une référence anti-âge du marché. Dans un futur proche, des tests complémentaires pourraient permettre une meilleure compréhension de la dégradation des cellules souches épidermiques au cours du vieillissement. [source]

Exchange-rate pass-through at the product level

CANADIAN JOURNAL OF ECONOMICS, Issue 2 2008
Guillaume Gaulier
Abstract., We use a detailed database to investigate exchange-rate pass-through at the product level for a large number of countries. The empirical analysis suggests that pricing behaviours are dichotomous, with complete pass-through in around 25% of sectors and significant pricing-to-market in the remaining ones. Average long-run pass-through coefficient is close to 80%; this result hides a strong heterogeneity of pass-through behaviours across sectors. Even when composition effects are controlled for, average pass-through varies across importing countries. The econometric analysis shows that pass-through tends to be higher in volatile environments; in less developed countries; in weakly integrated markets. Cet article utilise une base de données détaillée pour analyser l'effet du taux de change sur les prix à l'exportation, mesurés au niveau du produit. L'analyse empirique suggère que les comportements des prix sont dichotomiques: dans 25% des secteurs, les mouvements de change se répercutent entièrement sur les prix à l'importation tandis que la transmission est incomplète pour les autres. Le coefficient moyen de transmission est de 80%à long terme. Ce résultat cache cependant une grande hétérogénéité des comportements de transmission selon les secteurs. De plus, même quand on standardise pour tenir compte des effets de composition, le coefficient moyen de transmission varie selon les pays importateurs. En particulier, l'analyse économétrique montre que l'effet de transmission est plus élevé i) dans les environnements volatils, ii) dans les pays moins développés, et iii) dans les marchés plus faiblement intégrés. [source]